Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 AIM1YAL046C 357 nt9.34□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 RIM8YGL045W 1629 nt9.34□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 ENT4YLL038C 744 nt9.33□□□□□ -0.92
TY3A-GQ12173 REX2YLR059C 810 nt9.32□□□□□ -0.92
TY3A-GQ12173 YPL247CYPL247C 1572 nt9.31□□□□□ -0.92
TY3A-GQ12173 SAC7YDR389W 1965 nt9.3□□□□□ -0.92
TY3A-GQ12173 GID7YCL039W 2238 nt9.29□□□□□ -0.92
TY3A-GQ12173 MFT1YML062C 1179 nt9.29□□□□□ -0.92
TY3A-GQ12173 LSP1YPL004C 1026 nt9.29□□□□□ -0.92
TY3A-GQ12173 MUP1YGR055W 1725 nt9.28□□□□□ -0.92
TY3A-GQ12173 YGL114WYGL114W 2178 nt9.27□□□□□ -0.92
TY3A-GQ12173 TAD2YJL035C 753 nt9.27□□□□□ -0.93
TY3A-GQ12173 ADA2YDR448W 1305 nt9.27□□□□□ -0.93
TY3A-GQ12173 KEL3YPL263C 1956 nt9.25□□□□□ -0.93
TY3A-GQ12173 YFR020WYFR020W 699 nt9.23□□□□□ -0.93
TY3A-GQ12173 YMR166CYMR166C 1107 nt9.23□□□□□ -0.93
TY3A-GQ12173 SRP54YPR088C 1626 nt9.23□□□□□ -0.93
TY3A-GQ12173 YLR046CYLR046C 813 nt9.22□□□□□ -0.93
TY3A-GQ12173 SWT21YNL187W 1074 nt9.22□□□□□ -0.93
TY3A-GQ12173 ELO1YJL196C 933 nt9.21□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 YPT11YNL304W 1254 nt9.21□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 snR31snR31 225 nt9.21□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 ESBP6YNL125C 2022 nt9.21□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 PET18YCR020C 648 nt9.2□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 ELP4YPL101W 1371 nt9.19□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 PET494YNR045W 1470 nt9.19□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 HOL1YNR055C 1761 nt9.19□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 FUS3YBL016W 1062 nt9.18□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 UTR5YEL035C 501 nt9.17□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.17□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 RRT14YIL127C 621 nt9.17□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 RSM7YJR113C 744 nt9.17□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 YJL043WYJL043W 774 nt9.16□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 ADE1YAR015W 921 nt9.15□□□□□ -0.94
TY3A-GQ12173 MET1YKR069W 1782 nt9.14□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 YKL053WYKL053W 375 nt9.14□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 YPR084WYPR084W 1371 nt9.13□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 YBL095WYBL095W 813 nt9.13□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 MAE1YKL029C 2010 nt9.12□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 YJR149WYJR149W 1215 nt9.12□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 SFL1YOR140W 2301 nt9.12□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 KGD2YDR148C 1392 nt9.12□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 YER156CYER156C 1017 nt9.11□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 YLR460CYLR460C 1131 nt9.11□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 COS10YNR075W 1125 nt9.11□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 RPN14YGL004C 1254 nt9.1□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 CCT2YIL142W 1584 nt9.09□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 CAK1YFL029C 1107 nt9.09□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 TDH1YJL052W 999 nt9.09□□□□□ -0.95
TY3A-GQ12173 HAP5YOR358W 729 nt9.07□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 ILV3YJR016C 1758 nt9.07□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 RFC1YOR217W 2586 nt9.06□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 NUP53YMR153W 1428 nt9.05□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 SUV3YPL029W 2214 nt9.05□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 RPR1RPR1 369 nt9.05□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 YMR265CYMR265C 1386 nt9.04□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 SAN1YDR143C 1833 nt9.03□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 NPP1YCR026C 2229 nt9.03□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 CHS7YHR142W 951 nt9.03□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 CRC1YOR100C 984 nt9.03□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 RPS6AYPL090C 711 nt9.03□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 RPS6BYBR181C 711 nt9.03□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 OCH1YGL038C 1443 nt9.03□□□□□ -0.96
TY3A-GQ12173 YDR476CYDR476C 675 nt9.02□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 YOR325WYOR325W 474 nt9.02□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 ITR2YOL103W 1830 nt9.01□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 OPI10YOL032W 741 nt9.01□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 PTC6YCR079W 1329 nt9.01□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 GAS1YMR307W 1680 nt9□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 DTR1YBR180W 1719 nt9□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 BXI1YNL305C 894 nt8.99□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 OLA1YBR025C 1185 nt8.99□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 YMR209CYMR209C 1374 nt8.99□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 DLD3YEL071W 1491 nt8.98□□□□□ -0.97
TY3A-GQ12173 YPT31YER031C 672 nt8.96□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 HIS2YFR025C 1008 nt8.96□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 COQ8YGL119W 1506 nt8.95□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 MET22YOL064C 1074 nt8.95□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 VMA11YPL234C 495 nt8.95□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 MET2YNL277W 1461 nt8.95□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 ILV2YMR108W 2064 nt8.94□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 YLR358CYLR358C 564 nt8.94□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 UGP1YKL035W 1500 nt8.94□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 SBP1YHL034C 885 nt8.93□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 URA1YKL216W 945 nt8.93□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 YML079WYML079W 606 nt8.93□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 ATP2YJR121W 1536 nt8.93□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 SFP1YLR403W 2052 nt8.92□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 YHR219WYHR219W 1875 nt8.91□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 HEM14YER014W 1620 nt8.91□□□□□ -0.98
TY3A-GQ12173 PUP2YGR253C 783 nt8.89□□□□□ -0.99
TY3A-GQ12173 YIL168WYIL168W 384 nt8.89□□□□□ -0.99
TY3A-GQ12173 ARO8YGL202W 1503 nt8.89□□□□□ -0.99
TY3A-GQ12173 PDC6YGR087C 1692 nt8.88□□□□□ -0.99
TY3A-GQ12173 RRT6YGL146C 936 nt8.88□□□□□ -0.99
TY3A-GQ12173 SNX3YOR357C 489 nt8.88□□□□□ -0.99
TY3A-GQ12173 KES1YPL145C 1305 nt8.85□□□□□ -0.99
TY3A-GQ12173 SGA1YIL099W 1650 nt8.84□□□□□ -0.99
TY3A-GQ12173 MCM5YLR274W 2328 nt8.83□□□□□ -1
TY3A-GQ12173 LSR1LSR1 1175 nt8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 112.4 ms