Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 SFL1YOR140W 2301 nt9.02□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 YGL114WYGL114W 2178 nt9.01□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 GID8YMR135C 1368 nt9□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 SUV3YPL029W 2214 nt9□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 YGR139WYGR139W 339 nt9□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 YKL053WYKL053W 375 nt9□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 YPT11YNL304W 1254 nt9□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 RIM2YBR192W 1134 nt9□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 KES1YPL145C 1305 nt9□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 COQ8YGL119W 1506 nt8.97□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 CRC1YOR100C 984 nt8.97□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 YPL108WYPL108W 507 nt8.97□□□□□ -0.97
HFI1Q12060 YOR343CYOR343C 327 nt8.96□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 NPP1YCR026C 2229 nt8.96□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 RSM7YJR113C 744 nt8.95□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 LSR1LSR1 1175 nt8.95□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 SNX3YOR357C 489 nt8.95□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 HEL2YDR266C 1920 nt8.95□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 YKL133CYKL133C 1392 nt8.95□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 SFP1YLR403W 2052 nt8.94□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 GRH1YDR517W 1119 nt8.94□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 YFR020WYFR020W 699 nt8.94□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 HRA1HRA1 564 nt8.94□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 PAU21YOR394W 495 nt8.94□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 PAU22YPL282C 495 nt8.94□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 MET2YNL277W 1461 nt8.94□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 RPD3YNL330C 1302 nt8.93□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 MAS1YLR163C 1389 nt8.93□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 RSC4YKR008W 1878 nt8.93□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 YHR219WYHR219W 1875 nt8.92□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 SAN1YDR143C 1833 nt8.91□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 SGA1YIL099W 1650 nt8.91□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 RPL12BYDR418W 498 nt8.91□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 PAB1YER165W 1734 nt8.91□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 UGP1YKL035W 1500 nt8.9□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.9□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 EMC3YKL207W 762 nt8.9□□□□□ -0.98
HFI1Q12060 MRS6YOR370C 1812 nt8.89□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 YJL160CYJL160C 864 nt8.89□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 HIS2YFR025C 1008 nt8.88□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 GAS1YMR307W 1680 nt8.88□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 KGD2YDR148C 1392 nt8.87□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 PTC6YCR079W 1329 nt8.87□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 ESBP6YNL125C 2022 nt8.87□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 KRR1YCL059C 951 nt8.87□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 SBP1YHL034C 885 nt8.87□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 YMR166CYMR166C 1107 nt8.87□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 LSP1YPL004C 1026 nt8.87□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 YMR210WYMR210W 1350 nt8.86□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 YLR460CYLR460C 1131 nt8.86□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 MRP1YDR347W 966 nt8.84□□□□□ -0.99
HFI1Q12060 ZAP1YJL056C 2643 nt8.84□□□□□ -1
HFI1Q12060 MCM5YLR274W 2328 nt8.81□□□□□ -1
HFI1Q12060 CWP2YKL096W-A 279 nt8.8□□□□□ -1
HFI1Q12060 MFT1YML062C 1179 nt8.8□□□□□ -1
HFI1Q12060 YMR209CYMR209C 1374 nt8.79□□□□□ -1
HFI1Q12060 CHS7YHR142W 951 nt8.79□□□□□ -1
HFI1Q12060 RRT14YIL127C 621 nt8.79□□□□□ -1
HFI1Q12060 GDH1YOR375C 1365 nt8.77□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 RPC31YNL151C 756 nt8.77□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 CAK1YFL029C 1107 nt8.76□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 PET18YCR020C 648 nt8.75□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 CSM2YIL132C 642 nt8.75□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 OLA1YBR025C 1185 nt8.75□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 YOR268CYOR268C 399 nt8.75□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 YPR084WYPR084W 1371 nt8.73□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 OCH1YGL038C 1443 nt8.73□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 ADA2YDR448W 1305 nt8.73□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 GGA2YHR108W 1758 nt8.73□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 MAE1YKL029C 2010 nt8.73□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 ILV2YMR108W 2064 nt8.72□□□□□ -1.01
HFI1Q12060 SSL2YIL143C 2532 nt8.71□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 YDR306CYDR306C 1437 nt8.71□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 TAD2YJL035C 753 nt8.7□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 MET22YOL064C 1074 nt8.7□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 DTR1YBR180W 1719 nt8.69□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 YER156CYER156C 1017 nt8.69□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.69□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.69□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.69□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.69□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.69□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.69□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.69□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 YMR206WYMR206W 942 nt8.69□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 RFC1YOR217W 2586 nt8.68□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 UTR5YEL035C 501 nt8.68□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 EDC2YER035W 438 nt8.67□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 YIR035CYIR035C 765 nt8.67□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 ODC1YPL134C 933 nt8.67□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 PUS7YOR243C 2031 nt8.66□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 ELP4YPL101W 1371 nt8.66□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 YPT31YER031C 672 nt8.66□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.66□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 GPM1YKL152C 744 nt8.65□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 RPS6AYPL090C 711 nt8.65□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 RPS6BYBR181C 711 nt8.65□□□□□ -1.02
HFI1Q12060 PDC6YGR087C 1692 nt8.65□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 DPL1YDR294C 1770 nt8.64□□□□□ -1.03
HFI1Q12060 YDR467CYDR467C 327 nt8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms