Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRIP1P50238 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CRIP1P50238 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRIP1P50238 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRIP1P50238 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms