Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDIT3P35638 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
DDIT3P35638 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDIT3P35638 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDIT3P35638 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DDIT3P35638 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms