Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 214.02□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 REPIN1-211ENST00000486714 824 ntTSL 513.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ARHGEF17-205ENST00000543530 970 ntTSL 213.91□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.237e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.247e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PHF20-201ENST00000339089 1997 ntTSL 213.46□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.267e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PHF20-211ENST00000481202 1635 ntTSL 1 (best)13.17□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-211ENST00000460723 2534 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.317e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NFE2L1-208ENST00000579537 372 ntTSL 413.05□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 DDX27-204ENST00000484427 4929 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ARID1B-211ENST00000635928 1551 ntTSL 512.98□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PHF20-208ENST00000461405 550 ntTSL 212.75□□□□□ -0.377e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.427e-11■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PGD-205ENST00000483936 680 ntTSL 512.35□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PHF20-202ENST00000374000 1814 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.447e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.447e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 53.3
DDX6P26196 AC009005.1-202ENST00000588908 625 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.467e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.58e-13■■■■■ 53.3
DDX6P26196 EHBP1L1-202ENST00000526990 3169 nt11.91□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.58e-13■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-204ENST00000422020 1015 ntTSL 511.9□□□□□ -0.57e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 CLDN4-203ENST00000435050 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 511.88□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 AC009005.1-203ENST00000590292 509 ntTSL 211.86□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PGD-208ENST00000493288 476 ntTSL 311.85□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-207ENST00000435900 1723 ntTSL 511.45□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-211ENST00000512653 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 FAM107B-221ENST00000487335 2317 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 CLDN4-202ENST00000431918 4108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 IDS-207ENST00000490775 945 ntTSL 310.8□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 AC244197.3-202ENST00000441880 416 ntTSL 210.76□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PISD-201ENST00000266095 2655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.727e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NAA50-210ENST00000616174 3257 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.787e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NTN4-204ENST00000547980 749 ntTSL 310.09□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ARHGEF11-206ENST00000487682 4796 ntTSL 210.07□□□□□ -0.87e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 53.3
DDX6P26196 NTN4-202ENST00000344911 3152 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.837e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.888e-13■■■■■ 53.3
DDX6P26196 FAM107B-206ENST00000378470 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-206ENST00000504405 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 OAZ2-202ENST00000558194 7102 ntTSL 28.79□□□□□ -17e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 STXBP6-204ENST00000546511 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.017e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.037e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MRPL45P2-204ENST00000575291 1765 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.17e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 28.18□□□□□ -1.17e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MRPL45P2-202ENST00000572695 804 ntTSL 37.96□□□□□ -1.147e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 DDX27-203ENST00000471144 3639 ntTSL 1 (best)7.81□□□□□ -1.167e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 IDS-204ENST00000464251 959 ntTSL 57.7□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.197e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.268e-13■■■■■ 53.3
DDX6P26196 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.277e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 STXBP6-205ENST00000548182 3355 ntTSL 26.72□□□□□ -1.337e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 IDS-205ENST00000466019 537 ntTSL 26.3□□□□□ -1.47e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 RAPGEF2-206ENST00000505478 838 ntTSL 54.63□□□□□ -1.677e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.727e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 54.13□□□□□ -1.757e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 MED4-204ENST00000495013 460 ntTSL 33.83□□□□□ -1.87e-7■■■■■ 53.3
DDX6P26196 SPP1-203ENST00000395080 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.415e-10■■■■■ 53.2
DDX6P26196 SPP1-211ENST00000614857 1558 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.715e-10■■■■■ 53.2
DDX6P26196 SPP1-201ENST00000237623 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.995e-10■■■■■ 53.2
DDX6P26196 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.35e-10■■■■■ 53.2
DDX6P26196 SPP1-209ENST00000509659 1664 ntTSL 1 (best)6.68□□□□□ -1.345e-10■■■■■ 53.2
DDX6P26196 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.613e-38■■■■■ 52.8
DDX6P26196 EMD-207ENST00000486738 1284 ntTSL 318.57■□□□□ 0.563e-38■■■■■ 52.8
DDX6P26196 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 318.37■□□□□ 0.533e-38■■■■■ 52.8
DDX6P26196 EMD-208ENST00000492448 832 ntTSL 217.82■□□□□ 0.443e-38■■■■■ 52.8
DDX6P26196 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 52.6
DDX6P26196 NR1H2-205ENST00000595730 713 ntTSL 218.34■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 52.6
DDX6P26196 NR1H2-207ENST00000597130 894 ntTSL 317.45■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 52.6
DDX6P26196 NR1H2-209ENST00000597790 718 ntTSL 217.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 52.6
DDX6P26196 NR1H2-212ENST00000600355 507 ntTSL 315.39■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 52.6
DDX6P26196 RTEL1-207ENST00000463361 575 ntTSL 414.21□□□□□ -0.139e-9■■■■■ 52.6
DDX6P26196 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 52.2
DDX6P26196 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 52.2
DDX6P26196 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 52.2
DDX6P26196 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 52.2
Retrieved 100 of 14,483 protein–RNA pairs in 55.7 ms