RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463361.1

RTEL1-207, Transcript of regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

TSL 4

Gene RTEL1, Length 575 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-207ENST00000463361 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.58■■■□□ 2.81
RTEL1-207ENST00000463361 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.84■■■□□ 2.21
RTEL1-207ENST00000463361 ABCC9O60706 1549 aa28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-207ENST00000463361 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-207ENST00000463361 NACADO15069 1562 aa26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-207ENST00000463361 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.99■■□□□ 1.91
RTEL1-207ENST00000463361 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.96■■□□□ 1.91
RTEL1-207ENST00000463361 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.92■■□□□ 1.9
RTEL1-207ENST00000463361 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.91■■□□□ 1.9
RTEL1-207ENST00000463361 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.85■■□□□ 1.89
RTEL1-207ENST00000463361 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.45■■□□□ 1.83
RTEL1-207ENST00000463361 SCRIBQ14160 1630 aa26.32■■□□□ 1.8
RTEL1-207ENST00000463361 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
RTEL1-207ENST00000463361 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.2■■□□□ 1.78
RTEL1-207ENST00000463361 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.88■■□□□ 1.73
RTEL1-207ENST00000463361 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-207ENST00000463361 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-207ENST00000463361 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RTEL1-207ENST00000463361 SMARCA4P51532 1647 aa25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-207ENST00000463361 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RTEL1-207ENST00000463361 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.14■■□□□ 1.61
RTEL1-207ENST00000463361 PEG3Q9GZU2 1588 aa25■■□□□ 1.59
RTEL1-207ENST00000463361 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.97■■□□□ 1.59
RTEL1-207ENST00000463361 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-207ENST00000463361 SMARCA2P51531 1590 aa24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-207ENST00000463361 NCAPD3P42695 1498 aa24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-207ENST00000463361 WIZO95785 1651 aa24.9■■□□□ 1.58
RTEL1-207ENST00000463361 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.89■■□□□ 1.58
RTEL1-207ENST00000463361 HMGXB3Q12766 1538 aa24.83■■□□□ 1.57
RTEL1-207ENST00000463361 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
RTEL1-207ENST00000463361 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RTEL1-207ENST00000463361 CUX2O14529 1486 aa24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-207ENST00000463361 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
RTEL1-207ENST00000463361 ERCC6Q03468 1493 aa24.41■■□□□ 1.5
RTEL1-207ENST00000463361 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.32■■□□□ 1.48
RTEL1-207ENST00000463361 NESP48681 1621 aa24.23■■□□□ 1.47
RTEL1-207ENST00000463361 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.19■■□□□ 1.46
RTEL1-207ENST00000463361 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-207ENST00000463361 CFTRP13569 1480 aa24.13■■□□□ 1.45
RTEL1-207ENST00000463361 PRDM2Q13029 1718 aa24.04■■□□□ 1.44
RTEL1-207ENST00000463361 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.99■■□□□ 1.43
RTEL1-207ENST00000463361 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
RTEL1-207ENST00000463361 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.95■■□□□ 1.42
RTEL1-207ENST00000463361 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.9■■□□□ 1.42
RTEL1-207ENST00000463361 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.82■■□□□ 1.4
RTEL1-207ENST00000463361 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-207ENST00000463361 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RTEL1-207ENST00000463361 WDR62O43379 1518 aa23.69■■□□□ 1.38
RTEL1-207ENST00000463361 TRIM41Q8WV44 630 aa23.64■■□□□ 1.37
RTEL1-207ENST00000463361 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-207ENST00000463361 TOPBP1Q92547 1522 aa23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-207ENST00000463361 CUX1P39880 1505 aa23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-207ENST00000463361 ABCC8Q09428 1581 aa23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-207ENST00000463361 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-207ENST00000463361 SYNJ1O43426 1573 aa23.48■■□□□ 1.35
RTEL1-207ENST00000463361 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.46■■□□□ 1.35
RTEL1-207ENST00000463361 TOP2BQ02880 1626 aa23.44■■□□□ 1.34
RTEL1-207ENST00000463361 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RTEL1-207ENST00000463361 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.39■■□□□ 1.34
RTEL1-207ENST00000463361 OSCARQ8IYS5 282 aa23.37■■□□□ 1.33
RTEL1-207ENST00000463361 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
RTEL1-207ENST00000463361 IFT140Q96RY7 1462 aa23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-207ENST00000463361 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.3■■□□□ 1.32
RTEL1-207ENST00000463361 WDR97A6NE52 1622 aa23.27■■□□□ 1.32
RTEL1-207ENST00000463361 SOGA1O94964 1423 aa23.26■■□□□ 1.31
RTEL1-207ENST00000463361 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RTEL1-207ENST00000463361 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-207ENST00000463361 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RTEL1-207ENST00000463361 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.11■■□□□ 1.29
RTEL1-207ENST00000463361 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.291e-10■■■□□ 16.7
RTEL1-207ENST00000463361 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-207ENST00000463361 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-207ENST00000463361 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
RTEL1-207ENST00000463361 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
RTEL1-207ENST00000463361 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
RTEL1-207ENST00000463361 PBRM1Q86U86 1689 aa23.03■■□□□ 1.28
RTEL1-207ENST00000463361 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.02■■□□□ 1.28
RTEL1-207ENST00000463361 GRIN2BQ13224 1484 aa22.97■■□□□ 1.27
RTEL1-207ENST00000463361 ARHGEF11O15085 1522 aa22.94■■□□□ 1.26
RTEL1-207ENST00000463361 KIF27Q86VH2 1401 aa22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-207ENST00000463361 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.92■■□□□ 1.26
RTEL1-207ENST00000463361 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-207ENST00000463361 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.91■■□□□ 1.26
RTEL1-207ENST00000463361 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-207ENST00000463361 ADAMTS12P58397 1594 aa22.85■■□□□ 1.25
RTEL1-207ENST00000463361 IGF1RP08069 1367 aa22.84■■□□□ 1.25
RTEL1-207ENST00000463361 CHD1O14646 1710 aa22.83■■□□□ 1.25
RTEL1-207ENST00000463361 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.83■■□□□ 1.25
RTEL1-207ENST00000463361 SYNJ2O15056 1496 aa22.79■■□□□ 1.24
RTEL1-207ENST00000463361 CUL7Q14999 1698 aa22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-207ENST00000463361 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-207ENST00000463361 FBLN2P98095 1184 aa22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-207ENST00000463361 EEA1Q15075 1411 aa22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-207ENST00000463361 GRIN2AQ12879 1464 aa22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-207ENST00000463361 ARAP1Q96P48 1450 aa22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-207ENST00000463361 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-207ENST00000463361 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RTEL1-207ENST00000463361 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RTEL1-207ENST00000463361 PRXQ9BXM0 1461 aa22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-207ENST00000463361 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms