Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3BP20337 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3BP20337 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3BP20337 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms