Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRMP19623 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRMP19623 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRMP19623 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRMP19623 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRMP19623 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRMP19623 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRMP19623 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRMP19623 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRMP19623 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRMP19623 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRMP19623 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRMP19623 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRMP19623 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRMP19623 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SRMP19623 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRMP19623 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRMP19623 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRMP19623 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRMP19623 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRMP19623 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRMP19623 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRMP19623 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRMP19623 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SRMP19623 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRMP19623 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRMP19623 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRMP19623 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRMP19623 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRMP19623 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRMP19623 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRMP19623 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRMP19623 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRMP19623 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRMP19623 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRMP19623 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRMP19623 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRMP19623 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRMP19623 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRMP19623 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRMP19623 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRMP19623 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRMP19623 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRMP19623 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRMP19623 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRMP19623 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRMP19623 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRMP19623 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRMP19623 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRMP19623 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRMP19623 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRMP19623 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRMP19623 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRMP19623 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRMP19623 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRMP19623 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRMP19623 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRMP19623 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRMP19623 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRMP19623 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRMP19623 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRMP19623 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRMP19623 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRMP19623 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRMP19623 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRMP19623 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRMP19623 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRMP19623 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRMP19623 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRMP19623 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRMP19623 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRMP19623 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRMP19623 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRMP19623 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRMP19623 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRMP19623 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRMP19623 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRMP19623 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRMP19623 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRMP19623 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRMP19623 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRMP19623 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRMP19623 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRMP19623 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRMP19623 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRMP19623 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRMP19623 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRMP19623 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRMP19623 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRMP19623 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms