Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABRB1P18505 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABRB1P18505 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABRB1P18505 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRB1P18505 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB1P18505 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms