Protein–RNA interactions for Protein: H3BSH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSH0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BSH0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BSH0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BSH0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BSH0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BSH0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BSH0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BSH0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BSH0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BSH0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BSH0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BSH0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BSH0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BSH0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BSH0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BSH0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BSH0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BSH0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BSH0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BSH0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BSH0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BSH0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BSH0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BSH0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BSH0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BSH0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BSH0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BSH0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BSH0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BSH0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BSH0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BSH0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BSH0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BSH0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BSH0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BSH0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BSH0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BSH0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BSH0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BSH0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BSH0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BSH0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BSH0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BSH0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BSH0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BSH0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BSH0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BSH0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BSH0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BSH0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BSH0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BSH0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BSH0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BSH0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BSH0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BSH0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BSH0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BSH0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BSH0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BSH0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BSH0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3BSH0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BSH0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BSH0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BSH0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BSH0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3BSH0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BSH0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BSH0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BSH0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3BSH0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BSH0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BSH0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BSH0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BSH0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3BSH0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
H3BSH0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSH0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSH0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSH0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSH0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSH0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSH0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BSH0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSH0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSH0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSH0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSH0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSH0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSH0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BSH0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BSH0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BSH0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BSH0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BSH0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BSH0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BSH0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BSH0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BSH0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BSH0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms