Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMS2P5A8MQ11 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMS2P5A8MQ11 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMS2P5A8MQ11 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMS2P5A8MQ11 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.3 ms