Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV5S2A0A599 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV5S2A0A599 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCRBV5S2A0A599 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCRBV5S2A0A599 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCRBV5S2A0A599 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms