Protein–RNA interactions for Protein: Q8TGS9

YMR001C-A, Uncharacterized protein YMR001C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AQ8TGS9 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-1.57□□□□□ -2.66
YMR001C-AQ8TGS9 GPI15YNL038W 690 nt-1.57□□□□□ -2.66
YMR001C-AQ8TGS9 CSE2YNR010W 450 nt-1.57□□□□□ -2.66
YMR001C-AQ8TGS9 CBS1YDL069C 690 nt-1.58□□□□□ -2.66
YMR001C-AQ8TGS9 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-1.59□□□□□ -2.66
YMR001C-AQ8TGS9 YLR456WYLR456W 615 nt-1.59□□□□□ -2.66
YMR001C-AQ8TGS9 TOM22YNL131W 459 nt-1.59□□□□□ -2.66
YMR001C-AQ8TGS9 TSC3YBR058C-A 243 nt-1.59□□□□□ -2.66
YMR001C-AQ8TGS9 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-1.6□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 YAR029WYAR029W 225 nt-1.6□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 YNL266WYNL266W 420 nt-1.6□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 YFL012WYFL012W 447 nt-1.61□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 YBL071CYBL071C 309 nt-1.61□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 snR50snR50 90 nt-1.61□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 TAH1YCR060W 336 nt-1.62□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 snR77snR77 88 nt-1.62□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 snR9snR9 187 nt-1.62□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 snR39BsnR39B 96 nt-1.62□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 BI2Q0110 1272 nt-1.63□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-1.63□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 YAF9YNL107W 681 nt-1.63□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 YNL205CYNL205C 423 nt-1.63□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 PRM3YPL192C 402 nt-1.63□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 YGR069WYGR069W 336 nt-1.64□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 YOR121CYOR121C 306 nt-1.64□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 snR81snR81 201 nt-1.65□□□□□ -2.67
YMR001C-AQ8TGS9 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-1.66□□□□□ -2.68
YMR001C-AQ8TGS9 YKL044WYKL044W 321 nt-1.66□□□□□ -2.68
YMR001C-AQ8TGS9 YER090C-AYER090C-A 90 nt-1.68□□□□□ -2.68
YMR001C-AQ8TGS9 PCC1YKR095W-A 267 nt-1.68□□□□□ -2.68
YMR001C-AQ8TGS9 YBR285WYBR285W 435 nt-1.68□□□□□ -2.68
YMR001C-AQ8TGS9 YML099W-AYML099W-A 330 nt-1.69□□□□□ -2.68
YMR001C-AQ8TGS9 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.69□□□□□ -2.68
YMR001C-AQ8TGS9 YER175W-AYER175W-A 165 nt-1.71□□□□□ -2.68
YMR001C-AQ8TGS9 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.71□□□□□ -2.68
YMR001C-AQ8TGS9 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-1.73□□□□□ -2.69
YMR001C-AQ8TGS9 YLR269CYLR269C 351 nt-1.73□□□□□ -2.69
YMR001C-AQ8TGS9 snR34snR34 203 nt-1.73□□□□□ -2.69
YMR001C-AQ8TGS9 snR69snR69 101 nt-1.74□□□□□ -2.69
YMR001C-AQ8TGS9 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-1.74□□□□□ -2.69
YMR001C-AQ8TGS9 YIL029CYIL029C 429 nt-1.74□□□□□ -2.69
YMR001C-AQ8TGS9 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.74□□□□□ -2.69
YMR001C-AQ8TGS9 RDS3YPR094W 324 nt-1.76□□□□□ -2.69
YMR001C-AQ8TGS9 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.78□□□□□ -2.69
YMR001C-AQ8TGS9 RPS27BYHR021C 249 nt-1.79□□□□□ -2.7
YMR001C-AQ8TGS9 HMRA1YCR097W 381 nt-1.8□□□□□ -2.7
YMR001C-AQ8TGS9 YDL016CYDL016C 303 nt-1.8□□□□□ -2.7
YMR001C-AQ8TGS9 YAR047CYAR047C 321 nt-1.8□□□□□ -2.7
YMR001C-AQ8TGS9 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-1.8□□□□□ -2.7
YMR001C-AQ8TGS9 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-1.82□□□□□ -2.7
YMR001C-AQ8TGS9 snR67snR67 82 nt-1.83□□□□□ -2.7
YMR001C-AQ8TGS9 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-1.83□□□□□ -2.7
YMR001C-AQ8TGS9 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-1.83□□□□□ -2.7
YMR001C-AQ8TGS9 YLR202CYLR202C 327 nt-1.83□□□□□ -2.7
YMR001C-AQ8TGS9 YDR102CYDR102C 333 nt-1.86□□□□□ -2.71
YMR001C-AQ8TGS9 CSN9YDR179C 489 nt-1.86□□□□□ -2.71
YMR001C-AQ8TGS9 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-1.86□□□□□ -2.71
YMR001C-AQ8TGS9 YGL149WYGL149W 306 nt-1.87□□□□□ -2.71
YMR001C-AQ8TGS9 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-1.87□□□□□ -2.71
YMR001C-AQ8TGS9 YDR048CYDR048C 315 nt-1.88□□□□□ -2.71
YMR001C-AQ8TGS9 YOR309CYOR309C 381 nt-1.89□□□□□ -2.71
YMR001C-AQ8TGS9 YER137W-AYER137W-A 306 nt-1.98□□□□□ -2.73
YMR001C-AQ8TGS9 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-2.01□□□□□ -2.73
YMR001C-AQ8TGS9 YFL019CYFL019C 354 nt-2.04□□□□□ -2.74
YMR001C-AQ8TGS9 YDL158CYDL158C 309 nt-2.05□□□□□ -2.74
YMR001C-AQ8TGS9 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-2.06□□□□□ -2.74
YMR001C-AQ8TGS9 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-2.06□□□□□ -2.74
YMR001C-AQ8TGS9 YER097WYER097W 330 nt-2.07□□□□□ -2.74
YMR001C-AQ8TGS9 MPC1YGL080W 393 nt-2.07□□□□□ -2.74
YMR001C-AQ8TGS9 YFL032WYFL032W 321 nt-2.1□□□□□ -2.75
YMR001C-AQ8TGS9 EAF6YJR082C 342 nt-2.1□□□□□ -2.75
YMR001C-AQ8TGS9 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-2.1□□□□□ -2.75
YMR001C-AQ8TGS9 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-2.11□□□□□ -2.75
YMR001C-AQ8TGS9 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-2.11□□□□□ -2.75
YMR001C-AQ8TGS9 YBR178WYBR178W 375 nt-2.13□□□□□ -2.75
YMR001C-AQ8TGS9 snR60snR60 104 nt-2.14□□□□□ -2.75
YMR001C-AQ8TGS9 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-2.17□□□□□ -2.76
YMR001C-AQ8TGS9 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-2.17□□□□□ -2.76
YMR001C-AQ8TGS9 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-2.18□□□□□ -2.76
YMR001C-AQ8TGS9 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-2.18□□□□□ -2.76
YMR001C-AQ8TGS9 ATP6Q0085 780 nt-2.2□□□□□ -2.76
YMR001C-AQ8TGS9 YKL063CYKL063C 504 nt-2.2□□□□□ -2.76
YMR001C-AQ8TGS9 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2.2□□□□□ -2.76
YMR001C-AQ8TGS9 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.21□□□□□ -2.76
YMR001C-AQ8TGS9 ATP19YOL077W-A 207 nt-2.22□□□□□ -2.76
YMR001C-AQ8TGS9 YDR543CYDR543C 300 nt-2.23□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-2.23□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-2.23□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-2.25□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-2.26□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 snR54snR54 86 nt-2.26□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 YJR157WYJR157W 363 nt-2.27□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-2.28□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 YLR434CYLR434C 384 nt-2.28□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-2.28□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 YNL324WYNL324W 396 nt-2.28□□□□□ -2.77
YMR001C-AQ8TGS9 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-2.29□□□□□ -2.78
YMR001C-AQ8TGS9 YGL041CYGL041C 204 nt-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AQ8TGS9 YAL066WYAL066W 309 nt-2.3□□□□□ -2.78
YMR001C-AQ8TGS9 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-2.31□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 810.2 ms