Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
WDR53Q7Z5U6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
WDR53Q7Z5U6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms