Protein–RNA interactions for Protein: Q12504

RKM4, Ribosomal lysine N-methyltransferase 4, yeastyeast

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM4Q12504 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.64□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 YBR099CYBR099C 384 nt1.64□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 IRA1YBR140C 9279 nt1.64□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 SXM1YDR395W 2835 nt1.63□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 EST2YLR318W 2655 nt1.63□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.63□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 SPC110YDR356W 2835 nt1.62□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 QCR9YGR183C 201 nt1.62□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 SSK2YNR031C 4740 nt1.62□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 CDC39YCR093W 6327 nt1.6□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 SOM1YEL059C-A 225 nt1.59□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 YLR232WYLR232W 348 nt1.59□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 snR39BsnR39B 96 nt1.59□□□□□ -2.15
RKM4Q12504 FYV8YGR196C 2454 nt1.58□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 CDC25YLR310C 4770 nt1.57□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.57□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.57□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.57□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.57□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.57□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.57□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.57□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt1.56□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 PET127YOR017W 2403 nt1.56□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 PMP2YEL017C-A 132 nt1.55□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.55□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 ROM2YLR371W 4071 nt1.55□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 YGR130CYGR130C 2451 nt1.55□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 YDR544CYDR544C 429 nt1.54□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 MSH3YCR092C 3057 nt1.53□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 RAD9YDR217C 3930 nt1.53□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.53□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.53□□□□□ -2.16
RKM4Q12504 MSN5YDR335W 3675 nt1.53□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 YBL109WYBL109W 336 nt1.52□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 YBR178WYBR178W 375 nt1.52□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 SEC8YPR055W 3198 nt1.52□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.52□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 CCH1YGR217W 6120 nt1.51□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 TFB5YDR079C-A 219 nt1.51□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 LAA1YJL207C 6045 nt1.5□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 KAP120YPL125W 3099 nt1.5□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 HUG1YML058W-A 207 nt1.49□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 HKR1YDR420W 5409 nt1.48□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.47□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 CLU1YMR012W 3834 nt1.47□□□□□ -2.17
RKM4Q12504 STF2YGR008C 255 nt1.46□□□□□ -2.18
RKM4Q12504 PRP16YKR086W 3216 nt1.45□□□□□ -2.18
RKM4Q12504 YDR210WYDR210W 228 nt1.45□□□□□ -2.18
RKM4Q12504 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.45□□□□□ -2.18
RKM4Q12504 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.45□□□□□ -2.18
RKM4Q12504 COG6YNL041C 2520 nt1.44□□□□□ -2.18
RKM4Q12504 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.44□□□□□ -2.18
RKM4Q12504 YMR326CYMR326C 309 nt1.44□□□□□ -2.18
RKM4Q12504 snR61snR61 90 nt1.43□□□□□ -2.18
RKM4Q12504 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.43□□□□□ -2.18
RKM4Q12504 BEM3YPL115C 3387 nt1.39□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 SEC1YDR164C 2175 nt1.39□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 RPM2YML091C 3609 nt1.39□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.38□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 YJR029WYJR029W 5268 nt1.37□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.37□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 YDL073WYDL073W 2955 nt1.36□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 RCO1YMR075W 2055 nt1.36□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.35□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.35□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 YSP1YHR155W 3687 nt1.35□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 YHR217CYHR217C 462 nt1.34□□□□□ -2.19
RKM4Q12504 BIR1YJR089W 2865 nt1.33□□□□□ -2.2
RKM4Q12504 SPT7YBR081C 3999 nt1.32□□□□□ -2.2
RKM4Q12504 IML1YJR138W 4755 nt1.31□□□□□ -2.2
RKM4Q12504 SIP4YJL089W 2490 nt1.3□□□□□ -2.2
RKM4Q12504 UBP3YER151C 2739 nt1.3□□□□□ -2.2
RKM4Q12504 NST1YNL091W 3723 nt1.29□□□□□ -2.2
RKM4Q12504 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.29□□□□□ -2.2
RKM4Q12504 SBH1YER087C-B 249 nt1.28□□□□□ -2.2
RKM4Q12504 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.28□□□□□ -2.2
RKM4Q12504 YNL266WYNL266W 420 nt1.27□□□□□ -2.21
RKM4Q12504 GLG1YKR058W 1851 nt1.26□□□□□ -2.21
RKM4Q12504 ULP2YIL031W 3105 nt1.26□□□□□ -2.21
RKM4Q12504 NNF2YGR089W 2811 nt1.23□□□□□ -2.21
RKM4Q12504 RKR1YMR247C 4689 nt1.19□□□□□ -2.22
RKM4Q12504 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.16□□□□□ -2.22
RKM4Q12504 VAM6YDL077C 3150 nt1.14□□□□□ -2.23
RKM4Q12504 snR81snR81 201 nt1.13□□□□□ -2.23
RKM4Q12504 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.13□□□□□ -2.23
RKM4Q12504 SCC2YDR180W 4482 nt1.13□□□□□ -2.23
RKM4Q12504 SEC10YLR166C 2616 nt1.12□□□□□ -2.23
RKM4Q12504 YPR117WYPR117W 7470 nt1.12□□□□□ -2.23
RKM4Q12504 BUD3YCL014W 4911 nt1.12□□□□□ -2.23
RKM4Q12504 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.11□□□□□ -2.23
RKM4Q12504 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.1□□□□□ -2.23
RKM4Q12504 BEM2YER155C 6504 nt1.08□□□□□ -2.24
RKM4Q12504 CSE1YGL238W 2883 nt1.07□□□□□ -2.24
RKM4Q12504 DOP1YDR141C 5097 nt1.07□□□□□ -2.24
RKM4Q12504 PAU12YGR294W 363 nt1.07□□□□□ -2.24
RKM4Q12504 PAU24YBR301W 363 nt1.07□□□□□ -2.24
RKM4Q12504 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.06□□□□□ -2.24
RKM4Q12504 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.06□□□□□ -2.24
RKM4Q12504 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.06□□□□□ -2.24
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