Protein–RNA interactions for Protein: Q12445

POM34, Nucleoporin POM34, yeastyeast

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POM34Q12445 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.3□□□□□ -2.2
POM34Q12445 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.29□□□□□ -2.2
POM34Q12445 CCH1YGR217W 6120 nt1.28□□□□□ -2.2
POM34Q12445 CLU1YMR012W 3834 nt1.26□□□□□ -2.21
POM34Q12445 SEC8YPR055W 3198 nt1.26□□□□□ -2.21
POM34Q12445 KAP120YPL125W 3099 nt1.26□□□□□ -2.21
POM34Q12445 YLR232WYLR232W 348 nt1.26□□□□□ -2.21
POM34Q12445 YNL205CYNL205C 423 nt1.26□□□□□ -2.21
POM34Q12445 FYV8YGR196C 2454 nt1.26□□□□□ -2.21
POM34Q12445 RAD9YDR217C 3930 nt1.25□□□□□ -2.21
POM34Q12445 MEC1YBR136W 7107 nt1.25□□□□□ -2.21
POM34Q12445 snR85snR85 171 nt1.24□□□□□ -2.21
POM34Q12445 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.24□□□□□ -2.21
POM34Q12445 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.24□□□□□ -2.21
POM34Q12445 PET127YOR017W 2403 nt1.24□□□□□ -2.21
POM34Q12445 QCR9YGR183C 201 nt1.23□□□□□ -2.21
POM34Q12445 YDR544CYDR544C 429 nt1.22□□□□□ -2.21
POM34Q12445 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.21□□□□□ -2.22
POM34Q12445 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.21□□□□□ -2.22
POM34Q12445 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.21□□□□□ -2.22
POM34Q12445 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.21□□□□□ -2.22
POM34Q12445 snR39BsnR39B 96 nt1.21□□□□□ -2.22
POM34Q12445 PRP16YKR086W 3216 nt1.2□□□□□ -2.22
POM34Q12445 OST4YDL232W 111 nt1.2□□□□□ -2.22
POM34Q12445 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.19□□□□□ -2.22
POM34Q12445 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.19□□□□□ -2.22
POM34Q12445 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.18□□□□□ -2.22
POM34Q12445 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.16□□□□□ -2.22
POM34Q12445 NUP192YJL039C 5052 nt1.15□□□□□ -2.22
POM34Q12445 YBR099CYBR099C 384 nt1.15□□□□□ -2.23
POM34Q12445 BUD3YCL014W 4911 nt1.15□□□□□ -2.23
POM34Q12445 SPT7YBR081C 3999 nt1.15□□□□□ -2.23
POM34Q12445 SOM1YEL059C-A 225 nt1.14□□□□□ -2.23
POM34Q12445 BEM3YPL115C 3387 nt1.13□□□□□ -2.23
POM34Q12445 COG6YNL041C 2520 nt1.13□□□□□ -2.23
POM34Q12445 CAT8YMR280C 4302 nt1.11□□□□□ -2.23
POM34Q12445 YDL073WYDL073W 2955 nt1.1□□□□□ -2.23
POM34Q12445 YDR210WYDR210W 228 nt1.1□□□□□ -2.23
POM34Q12445 YSP1YHR155W 3687 nt1.1□□□□□ -2.23
POM34Q12445 YJR029WYJR029W 5268 nt1.09□□□□□ -2.24
POM34Q12445 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.24
POM34Q12445 SEC1YDR164C 2175 nt1.08□□□□□ -2.24
POM34Q12445 UBP3YER151C 2739 nt1.08□□□□□ -2.24
POM34Q12445 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.08□□□□□ -2.24
POM34Q12445 NST1YNL091W 3723 nt1.08□□□□□ -2.24
POM34Q12445 LAA1YJL207C 6045 nt1.08□□□□□ -2.24
POM34Q12445 YGR130CYGR130C 2451 nt1.07□□□□□ -2.24
POM34Q12445 RPM2YML091C 3609 nt1.06□□□□□ -2.24
POM34Q12445 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.04□□□□□ -2.24
POM34Q12445 RKR1YMR247C 4689 nt1.03□□□□□ -2.24
POM34Q12445 PMP2YEL017C-A 132 nt1.03□□□□□ -2.24
POM34Q12445 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.03□□□□□ -2.24
POM34Q12445 MSH3YCR092C 3057 nt1.02□□□□□ -2.25
POM34Q12445 STF2YGR008C 255 nt1.01□□□□□ -2.25
POM34Q12445 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1□□□□□ -2.25
POM34Q12445 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1□□□□□ -2.25
POM34Q12445 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1□□□□□ -2.25
POM34Q12445 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1□□□□□ -2.25
POM34Q12445 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1□□□□□ -2.25
POM34Q12445 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1□□□□□ -2.25
POM34Q12445 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1□□□□□ -2.25
POM34Q12445 GLG1YKR058W 1851 nt1□□□□□ -2.25
POM34Q12445 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
POM34Q12445 ULP2YIL031W 3105 nt0.99□□□□□ -2.25
POM34Q12445 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.98□□□□□ -2.25
POM34Q12445 SCC2YDR180W 4482 nt0.97□□□□□ -2.25
POM34Q12445 BIR1YJR089W 2865 nt0.96□□□□□ -2.26
POM34Q12445 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.94□□□□□ -2.26
POM34Q12445 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.94□□□□□ -2.26
POM34Q12445 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.94□□□□□ -2.26
POM34Q12445 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.94□□□□□ -2.26
POM34Q12445 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.94□□□□□ -2.26
POM34Q12445 ANS1YHR126C 480 nt0.94□□□□□ -2.26
POM34Q12445 NNF2YGR089W 2811 nt0.93□□□□□ -2.26
POM34Q12445 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.93□□□□□ -2.26
POM34Q12445 RCO1YMR075W 2055 nt0.92□□□□□ -2.26
POM34Q12445 TFB5YDR079C-A 219 nt0.92□□□□□ -2.26
POM34Q12445 YPR117WYPR117W 7470 nt0.91□□□□□ -2.26
POM34Q12445 snR61snR61 90 nt0.91□□□□□ -2.26
POM34Q12445 YNL266WYNL266W 420 nt0.91□□□□□ -2.26
POM34Q12445 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.9□□□□□ -2.27
POM34Q12445 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.9□□□□□ -2.27
POM34Q12445 YBL109WYBL109W 336 nt0.87□□□□□ -2.27
POM34Q12445 YBR178WYBR178W 375 nt0.87□□□□□ -2.27
POM34Q12445 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.86□□□□□ -2.27
POM34Q12445 BEM2YER155C 6504 nt0.86□□□□□ -2.27
POM34Q12445 CSE1YGL238W 2883 nt0.86□□□□□ -2.27
POM34Q12445 IML1YJR138W 4755 nt0.85□□□□□ -2.27
POM34Q12445 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt0.85□□□□□ -2.27
POM34Q12445 SIP4YJL089W 2490 nt0.84□□□□□ -2.27
POM34Q12445 YMR326CYMR326C 309 nt0.84□□□□□ -2.27
POM34Q12445 BUL2YML111W 2763 nt0.84□□□□□ -2.28
POM34Q12445 DOP1YDR141C 5097 nt0.83□□□□□ -2.28
POM34Q12445 NIP1YMR309C 2439 nt0.83□□□□□ -2.28
POM34Q12445 HUG1YML058W-A 207 nt0.82□□□□□ -2.28
POM34Q12445 SEC10YLR166C 2616 nt0.81□□□□□ -2.28
POM34Q12445 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.81□□□□□ -2.28
POM34Q12445 PET111YMR257C 2403 nt0.8□□□□□ -2.28
POM34Q12445 RPS26AYGL189C 360 nt0.79□□□□□ -2.28
POM34Q12445 LTE1YAL024C 4308 nt0.78□□□□□ -2.29
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