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Protein–RNA interactions for Protein: Q12445
POM34, Nucleoporin POM34, yeast
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299 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
POM34
Q12445
YCL001W-B
YCL001W-B
255 nt
1.3
□□□□□ -2.2
POM34
Q12445
YOR329W-A
YOR329W-A
210 nt
1.29
□□□□□ -2.2
POM34
Q12445
CCH1
YGR217W
6120 nt
1.28
□□□□□ -2.2
POM34
Q12445
CLU1
YMR012W
3834 nt
1.26
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
SEC8
YPR055W
3198 nt
1.26
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
KAP120
YPL125W
3099 nt
1.26
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
YLR232W
YLR232W
348 nt
1.26
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
YNL205C
YNL205C
423 nt
1.26
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
FYV8
YGR196C
2454 nt
1.26
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
RAD9
YDR217C
3930 nt
1.25
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
MEC1
YBR136W
7107 nt
1.25
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
snR85
snR85
171 nt
1.24
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
tQ(UUG)E2
tQ(UUG)E2
72 nt
1.24
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
YNL284C-B
YNL284C-B
5268 nt
1.24
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
PET127
YOR017W
2403 nt
1.24
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
QCR9
YGR183C
201 nt
1.23
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
YDR544C
YDR544C
429 nt
1.22
□□□□□ -2.21
POM34
Q12445
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
1.21
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
YLR399W-A
YLR399W-A
105 nt
1.21
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
YNL067W-B
YNL067W-B
141 nt
1.21
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
YPR160W-A
YPR160W-A
81 nt
1.21
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
snR39B
snR39B
96 nt
1.21
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
PRP16
YKR086W
3216 nt
1.2
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
OST4
YDL232W
111 nt
1.2
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
tM(CAU)Q2
tM(CAU)Q2
78 nt
1.19
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
tN(GUU)Q
tN(GUU)Q
71 nt
1.19
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
YIL071W-A
YIL071W-A
477 nt
1.18
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
YCR095W-A
YCR095W-A
159 nt
1.16
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
NUP192
YJL039C
5052 nt
1.15
□□□□□ -2.22
POM34
Q12445
YBR099C
YBR099C
384 nt
1.15
□□□□□ -2.23
POM34
Q12445
BUD3
YCL014W
4911 nt
1.15
□□□□□ -2.23
POM34
Q12445
SPT7
YBR081C
3999 nt
1.15
□□□□□ -2.23
POM34
Q12445
SOM1
YEL059C-A
225 nt
1.14
□□□□□ -2.23
POM34
Q12445
BEM3
YPL115C
3387 nt
1.13
□□□□□ -2.23
POM34
Q12445
COG6
YNL041C
2520 nt
1.13
□□□□□ -2.23
POM34
Q12445
CAT8
YMR280C
4302 nt
1.11
□□□□□ -2.23
POM34
Q12445
YDL073W
YDL073W
2955 nt
1.1
□□□□□ -2.23
POM34
Q12445
YDR210W
YDR210W
228 nt
1.1
□□□□□ -2.23
POM34
Q12445
YSP1
YHR155W
3687 nt
1.1
□□□□□ -2.23
POM34
Q12445
YJR029W
YJR029W
5268 nt
1.09
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
YPR137C-B
YPR137C-B
5268 nt
1.09
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
SEC1
YDR164C
2175 nt
1.08
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
UBP3
YER151C
2739 nt
1.08
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
YJL127W-A
YJL127W-A
117 nt
1.08
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
NST1
YNL091W
3723 nt
1.08
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
LAA1
YJL207C
6045 nt
1.08
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
YGR130C
YGR130C
2451 nt
1.07
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
RPM2
YML091C
3609 nt
1.06
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
YGR146C-A
YGR146C-A
162 nt
1.04
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
RKR1
YMR247C
4689 nt
1.03
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
PMP2
YEL017C-A
132 nt
1.03
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
YBR072C-A
YBR072C-A
162 nt
1.03
□□□□□ -2.24
POM34
Q12445
MSH3
YCR092C
3057 nt
1.02
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
STF2
YGR008C
255 nt
1.01
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
tH(GUG)E1
tH(GUG)E1
72 nt
1
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
tH(GUG)E2
tH(GUG)E2
72 nt
1
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
tH(GUG)G1
tH(GUG)G1
72 nt
1
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
tH(GUG)G2
tH(GUG)G2
72 nt
1
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
tH(GUG)H
tH(GUG)H
72 nt
1
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
tH(GUG)K
tH(GUG)K
72 nt
1
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
tH(GUG)M
tH(GUG)M
72 nt
1
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
GLG1
YKR058W
1851 nt
1
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
VAM6
YDL077C
3150 nt
1
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
ULP2
YIL031W
3105 nt
0.99
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
YNL103W-A
YNL103W-A
90 nt
0.98
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
SCC2
YDR180W
4482 nt
0.97
□□□□□ -2.25
POM34
Q12445
BIR1
YJR089W
2865 nt
0.96
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
EMT1
tM(CAU)D
73 nt
0.94
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
EMT5
tM(CAU)J1
73 nt
0.94
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
EMT3
tM(CAU)J2
73 nt
0.94
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
EMT4
tM(CAU)M
73 nt
0.94
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
EMT2
tM(CAU)O2
73 nt
0.94
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
ANS1
YHR126C
480 nt
0.94
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
NNF2
YGR089W
2811 nt
0.93
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
YLL006W-A
YLL006W-A
177 nt
0.93
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
RCO1
YMR075W
2055 nt
0.92
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
TFB5
YDR079C-A
219 nt
0.92
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
YPR117W
YPR117W
7470 nt
0.91
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
snR61
snR61
90 nt
0.91
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
YNL266W
YNL266W
420 nt
0.91
□□□□□ -2.26
POM34
Q12445
tV(UAC)B
tV(UAC)B
74 nt
0.9
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
tV(UAC)D
tV(UAC)D
74 nt
0.9
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
YBL109W
YBL109W
336 nt
0.87
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
YBR178W
YBR178W
375 nt
0.87
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
YOR192C-B
YOR192C-B
5313 nt
0.86
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
BEM2
YER155C
6504 nt
0.86
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
CSE1
YGL238W
2883 nt
0.86
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
IML1
YJR138W
4755 nt
0.85
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
YDR524C-A
YDR524C-A
120 nt
0.85
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
SIP4
YJL089W
2490 nt
0.84
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
YMR326C
YMR326C
309 nt
0.84
□□□□□ -2.27
POM34
Q12445
BUL2
YML111W
2763 nt
0.84
□□□□□ -2.28
POM34
Q12445
DOP1
YDR141C
5097 nt
0.83
□□□□□ -2.28
POM34
Q12445
NIP1
YMR309C
2439 nt
0.83
□□□□□ -2.28
POM34
Q12445
HUG1
YML058W-A
207 nt
0.82
□□□□□ -2.28
POM34
Q12445
SEC10
YLR166C
2616 nt
0.81
□□□□□ -2.28
POM34
Q12445
YGL041C-B
YGL041C-B
183 nt
0.81
□□□□□ -2.28
POM34
Q12445
PET111
YMR257C
2403 nt
0.8
□□□□□ -2.28
POM34
Q12445
RPS26A
YGL189C
360 nt
0.79
□□□□□ -2.28
POM34
Q12445
LTE1
YAL024C
4308 nt
0.78
□□□□□ -2.29
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