Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 ABF2YMR072W 552 nt0.8□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 YOL014WYOL014W 375 nt0.8□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.8□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.8□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.79□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 YOR345CYOR345C 351 nt0.79□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 PRP16YKR086W 3216 nt0.78□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.78□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 snR190snR190 190 nt0.78□□□□□ -2.28
SNU66Q12420 snR8snR8 190 nt0.77□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YLR282CYLR282C 342 nt0.77□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YOR302WYOR302W 78 nt0.77□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.77□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.77□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YKU70YMR284W 1809 nt0.76□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 COX12YLR038C 252 nt0.76□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 CHS6YJL099W 2241 nt0.75□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.75□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YDR366CYDR366C 399 nt0.75□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.75□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 ULI1YFR026C 510 nt0.74□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.73□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.72□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YML002WYML002W 2214 nt0.72□□□□□ -2.29
SNU66Q12420 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.71□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 BIR1YJR089W 2865 nt0.7□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 COX5BYIL111W 456 nt0.7□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 PRP5YBR237W 2550 nt0.7□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 SEC8YPR055W 3198 nt0.69□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 APQ12YIL040W 417 nt0.69□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 BLI1YKL061W 342 nt0.69□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.69□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 FYV10YIL097W 1551 nt0.69□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.67□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 MLP1YKR095W 5628 nt0.66□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 ULP2YIL031W 3105 nt0.65□□□□□ -2.3
SNU66Q12420 OST4YDL232W 111 nt0.64□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.64□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.64□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.64□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 BEM3YPL115C 3387 nt0.64□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 YEL014CYEL014C 306 nt0.62□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.62□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 YLR041WYLR041W 321 nt0.62□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 PRP42YDR235W 1635 nt0.62□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 UTP10YJL109C 5310 nt0.62□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 HAL9YOL089C 3093 nt0.61□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 AI1Q0050 2505 nt0.61□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.61□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 TRS65YGR166W 1683 nt0.61□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 FMP27YLR454W 7887 nt0.61□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 IQG1YPL242C 4488 nt0.61□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.6□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 MLP2YIL149C 5040 nt0.6□□□□□ -2.31
SNU66Q12420 YJL182CYJL182C 318 nt0.57□□□□□ -2.32
SNU66Q12420 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.56□□□□□ -2.32
SNU66Q12420 PRP39YML046W 1890 nt0.55□□□□□ -2.32
SNU66Q12420 SNU13YEL026W 381 nt0.55□□□□□ -2.32
SNU66Q12420 UTP8YGR128C 2142 nt0.55□□□□□ -2.32
SNU66Q12420 TAH1YCR060W 336 nt0.53□□□□□ -2.32
SNU66Q12420 YDR544CYDR544C 429 nt0.53□□□□□ -2.32
SNU66Q12420 PET111YMR257C 2403 nt0.53□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 snR52snR52 92 nt0.52□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 NNF2YGR089W 2811 nt0.51□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 THO2YNL139C 4794 nt0.51□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 JLP2YMR132C 627 nt0.51□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 YLR232WYLR232W 348 nt0.49□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.49□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 ORC3YLL004W 1851 nt0.48□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.48□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 SPG3YDR504C 384 nt0.48□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 SBH1YER087C-B 249 nt0.48□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.48□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 RPS26AYGL189C 360 nt0.47□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 YSP1YHR155W 3687 nt0.47□□□□□ -2.33
SNU66Q12420 YGL182CYGL182C 324 nt0.46□□□□□ -2.34
SNU66Q12420 snR46snR46 197 nt0.46□□□□□ -2.34
SNU66Q12420 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.45□□□□□ -2.34
SNU66Q12420 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.45□□□□□ -2.34
SNU66Q12420 NIP1YMR309C 2439 nt0.44□□□□□ -2.34
SNU66Q12420 BUL2YML111W 2763 nt0.43□□□□□ -2.34
SNU66Q12420 SDH6YDR379C-A 240 nt0.43□□□□□ -2.34
SNU66Q12420 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.42□□□□□ -2.34
SNU66Q12420 YJL150WYJL150W 303 nt0.41□□□□□ -2.34
SNU66Q12420 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.41□□□□□ -2.34
SNU66Q12420 YEL073CYEL073C 324 nt0.39□□□□□ -2.35
SNU66Q12420 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.39□□□□□ -2.35
SNU66Q12420 COG6YNL041C 2520 nt0.38□□□□□ -2.35
SNU66Q12420 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.36□□□□□ -2.35
SNU66Q12420 RCO1YMR075W 2055 nt0.35□□□□□ -2.35
SNU66Q12420 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.33□□□□□ -2.36
SNU66Q12420 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.33□□□□□ -2.36
SNU66Q12420 GLG1YKR058W 1851 nt0.33□□□□□ -2.36
SNU66Q12420 CSE1YGL238W 2883 nt0.32□□□□□ -2.36
SNU66Q12420 YDR210WYDR210W 228 nt0.31□□□□□ -2.36
SNU66Q12420 YNL198CYNL198C 303 nt0.31□□□□□ -2.36
SNU66Q12420 YOR170WYOR170W 306 nt0.31□□□□□ -2.36
SNU66Q12420 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.31□□□□□ -2.36
SNU66Q12420 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.3□□□□□ -2.36
SNU66Q12420 ESP1YGR098C 4893 nt0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.9 ms