Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 CDC25YLR310C 4770 nt1.52□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 SET3YKR029C 2256 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 MON2YNL297C 4911 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 KAP120YPL125W 3099 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 IRA1YBR140C 9279 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 YDR210WYDR210W 228 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 KAP122YGL016W 3246 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 DNF3YMR162C 4971 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 GEA2YEL022W 4380 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 BIR1YJR089W 2865 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 BEM3YPL115C 3387 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 RCO1YMR075W 2055 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 YNL266WYNL266W 420 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 KCS1YDR017C 3153 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 MEC1YBR136W 7107 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 RPM2YML091C 3609 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM13Q12383 PRP16YKR086W 3216 nt1.45□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 SEC1YDR164C 2175 nt1.45□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 snR81snR81 201 nt1.45□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 NUP145YGL092W 3954 nt1.45□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 CFT1YDR301W 4074 nt1.45□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 SWI4YER111C 3282 nt1.44□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 SPC110YDR356W 2835 nt1.44□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 COG6YNL041C 2520 nt1.44□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 BST1YFL025C 3090 nt1.44□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.44□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 RAD9YDR217C 3930 nt1.44□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 NUP157YER105C 4176 nt1.43□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 SEC8YPR055W 3198 nt1.43□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 HKR1YDR420W 5409 nt1.42□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 CCH1YGR217W 6120 nt1.41□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 snR45snR45 172 nt1.41□□□□□ -2.18
TRM13Q12383 YDL073WYDL073W 2955 nt1.4□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 PMD1YER132C 5262 nt1.4□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 SXM1YDR395W 2835 nt1.4□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 AZF1YOR113W 2745 nt1.4□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 MSN5YDR335W 3675 nt1.4□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 TRM732YMR259C 4263 nt1.38□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 SEC3YER008C 4011 nt1.37□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.37□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 CLU1YMR012W 3834 nt1.36□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 snR62snR62 100 nt1.36□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.36□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.35□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 REV3YPL167C 4515 nt1.35□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 ASE1YOR058C 2658 nt1.34□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.34□□□□□ -2.19
TRM13Q12383 PIK1YNL267W 3201 nt1.34□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 YSP1YHR155W 3687 nt1.34□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 EST2YLR318W 2655 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 BUD3YCL014W 4911 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 UBP3YER151C 2739 nt1.32□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 NUP188YML103C 4968 nt1.31□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 PET127YOR017W 2403 nt1.31□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.31□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.3□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.3□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 FYV8YGR196C 2454 nt1.3□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 SAC3YDR159W 3906 nt1.29□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 GLG1YKR058W 1851 nt1.29□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 SSK2YNR031C 4740 nt1.28□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 BRR2YER172C 6492 nt1.28□□□□□ -2.2
TRM13Q12383 SEC10YLR166C 2616 nt1.27□□□□□ -2.21
TRM13Q12383 ULP2YIL031W 3105 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM13Q12383 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM13Q12383 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM13Q12383 CDC39YCR093W 6327 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM13Q12383 CAT8YMR280C 4302 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM13Q12383 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 NNF2YGR089W 2811 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 ANS1YHR126C 480 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 RPS26AYGL189C 360 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 HUG1YML058W-A 207 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 CSE1YGL238W 2883 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 MSH3YCR092C 3057 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM13Q12383 YJR029WYJR029W 5268 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM13Q12383 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM13Q12383 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM13Q12383 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.11□□□□□ -2.23
TRM13Q12383 snR47snR47 99 nt1.11□□□□□ -2.23
TRM13Q12383 EST1YLR233C 2100 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM13Q12383 SPT7YBR081C 3999 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM13Q12383 snR69snR69 101 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM13Q12383 LAA1YJL207C 6045 nt1.09□□□□□ -2.23
TRM13Q12383 YGR130CYGR130C 2451 nt1.09□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 RDS3YPR094W 324 nt1.08□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.06□□□□□ -2.24
TRM13Q12383 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms