Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YML002WYML002W 2214 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 PAU12YGR294W 363 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 UTP10YJL109C 5310 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 YOR302WYOR302W 78 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 YMR160WYMR160W 2451 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 QCR9YGR183C 201 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 YML099W-AYML099W-A 330 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 ABF2YMR072W 552 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 SEC8YPR055W 3198 nt0.59□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 OST4YDL232W 111 nt0.59□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt0.59□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.59□□□□□ -2.31
LDB17Q12342 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.58□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 snR55snR55 98 nt0.58□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.58□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 COX5BYIL111W 456 nt0.58□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YLR041WYLR041W 321 nt0.58□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YKU70YMR284W 1809 nt0.57□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.57□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.57□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 HAL9YOL089C 3093 nt0.56□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.56□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YDR366CYDR366C 399 nt0.55□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt0.55□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 PRP42YDR235W 1635 nt0.55□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 APQ12YIL040W 417 nt0.54□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.54□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 BLI1YKL061W 342 nt0.54□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.53□□□□□ -2.32
LDB17Q12342 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.52□□□□□ -2.33
LDB17Q12342 YOL014WYOL014W 375 nt0.52□□□□□ -2.33
LDB17Q12342 snR8snR8 190 nt0.5□□□□□ -2.33
LDB17Q12342 YEL014CYEL014C 306 nt0.47□□□□□ -2.33
LDB17Q12342 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.47□□□□□ -2.33
LDB17Q12342 ULP2YIL031W 3105 nt0.47□□□□□ -2.33
LDB17Q12342 PRP39YML046W 1890 nt0.46□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 YSP1YHR155W 3687 nt0.46□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 SNU13YEL026W 381 nt0.45□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 FMP27YLR454W 7887 nt0.45□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 ORC3YLL004W 1851 nt0.44□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 PET111YMR257C 2403 nt0.44□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 SBH1YER087C-B 249 nt0.44□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.44□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 BIR1YJR089W 2865 nt0.44□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 BUL2YML111W 2763 nt0.43□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.43□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 YJL182CYJL182C 318 nt0.43□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 NNF2YGR089W 2811 nt0.43□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 BEM3YPL115C 3387 nt0.42□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 RPS26AYGL189C 360 nt0.42□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 MLP1YKR095W 5628 nt0.42□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 IQG1YPL242C 4488 nt0.41□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 TRS65YGR166W 1683 nt0.4□□□□□ -2.34
LDB17Q12342 TAH1YCR060W 336 nt0.4□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 AI1Q0050 2505 nt0.4□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 MLP2YIL149C 5040 nt0.39□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 YDR544CYDR544C 429 nt0.39□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.39□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 NIP1YMR309C 2439 nt0.39□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 THO2YNL139C 4794 nt0.38□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.37□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 YLR232WYLR232W 348 nt0.36□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 UTP8YGR128C 2142 nt0.35□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 RCO1YMR075W 2055 nt0.35□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 snR46snR46 197 nt0.35□□□□□ -2.35
LDB17Q12342 SDH6YDR379C-A 240 nt0.34□□□□□ -2.36
LDB17Q12342 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.34□□□□□ -2.36
LDB17Q12342 YGL182CYGL182C 324 nt0.33□□□□□ -2.36
LDB17Q12342 ESP1YGR098C 4893 nt0.32□□□□□ -2.36
LDB17Q12342 YEL073CYEL073C 324 nt0.32□□□□□ -2.36
LDB17Q12342 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt0.3□□□□□ -2.36
LDB17Q12342 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.29□□□□□ -2.36
LDB17Q12342 snR52snR52 92 nt0.29□□□□□ -2.36
LDB17Q12342 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.29□□□□□ -2.36
LDB17Q12342 COG6YNL041C 2520 nt0.28□□□□□ -2.36
LDB17Q12342 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.27□□□□□ -2.37
LDB17Q12342 JLP2YMR132C 627 nt0.26□□□□□ -2.37
LDB17Q12342 YJL150WYJL150W 303 nt0.25□□□□□ -2.37
LDB17Q12342 GLG1YKR058W 1851 nt0.24□□□□□ -2.37
LDB17Q12342 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.24□□□□□ -2.37
LDB17Q12342 SPG3YDR504C 384 nt0.23□□□□□ -2.37
LDB17Q12342 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.21□□□□□ -2.38
LDB17Q12342 YOR170WYOR170W 306 nt0.21□□□□□ -2.38
LDB17Q12342 snR39BsnR39B 96 nt0.2□□□□□ -2.38
LDB17Q12342 CSE1YGL238W 2883 nt0.2□□□□□ -2.38
LDB17Q12342 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.19□□□□□ -2.38
LDB17Q12342 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.19□□□□□ -2.38
LDB17Q12342 SOV1YMR066W 2697 nt0.19□□□□□ -2.38
LDB17Q12342 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.18□□□□□ -2.38
LDB17Q12342 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 127.8 ms