Protein–RNA interactions for Protein: Q12306

SMT3, Ubiquitin-like protein SMT3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMT3Q12306 YDR413CYDR413C 576 nt0.13□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 ATP6Q0085 780 nt0.13□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 SNU13YEL026W 381 nt0.13□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.13□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 RAD61YDR014W 1944 nt0.11□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 GIM4YEL003W 336 nt0.11□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 YER097WYER097W 330 nt0.11□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 COX12YLR038C 252 nt0.11□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 YDR366CYDR366C 399 nt0.1□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 FMP27YLR454W 7887 nt0.09□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 TRS65YGR166W 1683 nt0.09□□□□□ -2.39
SMT3Q12306 YEL073CYEL073C 324 nt0.09□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.09□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 ULP2YIL031W 3105 nt0.09□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.08□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YKL118WYKL118W 312 nt0.08□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YGL052WYGL052W 306 nt0.07□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 BUL2YML111W 2763 nt0.06□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.06□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.06□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 STE5YDR103W 2754 nt0.06□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YKU70YMR284W 1809 nt0.06□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.05□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.05□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 ESP1YGR098C 4893 nt0.04□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.04□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 HMRA1YCR097W 381 nt0.04□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.04□□□□□ -2.4
SMT3Q12306 UTP20YBL004W 7482 nt0.02□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.02□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 RPL39YJL189W 156 nt0.02□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 snR56snR56 88 nt0.01□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt0□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 CSE1YGL238W 2883 nt-0□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 UTP8YGR128C 2142 nt-0.01□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.01□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.02□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 YDR544CYDR544C 429 nt-0.02□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 APQ12YIL040W 417 nt-0.02□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 YLR232WYLR232W 348 nt-0.02□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-0.02□□□□□ -2.41
SMT3Q12306 AI1Q0050 2505 nt-0.04□□□□□ -2.42
SMT3Q12306 SOV1YMR066W 2697 nt-0.04□□□□□ -2.42
SMT3Q12306 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-0.04□□□□□ -2.42
SMT3Q12306 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-0.05□□□□□ -2.42
SMT3Q12306 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.06□□□□□ -2.42
SMT3Q12306 TAH1YCR060W 336 nt-0.07□□□□□ -2.42
SMT3Q12306 GLG1YKR058W 1851 nt-0.07□□□□□ -2.42
SMT3Q12306 MLP2YIL149C 5040 nt-0.09□□□□□ -2.42
SMT3Q12306 YBR099CYBR099C 384 nt-0.1□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-0.1□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 YGL041CYGL041C 204 nt-0.11□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-0.12□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 snR128snR128 126 nt-0.12□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 THO2YNL139C 4794 nt-0.12□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 EST1YLR233C 2100 nt-0.13□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-0.13□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-0.14□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 COG6YNL041C 2520 nt-0.14□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 PRP39YML046W 1890 nt-0.14□□□□□ -2.43
SMT3Q12306 HUG1YML058W-A 207 nt-0.17□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 snR8snR8 190 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 YEL014CYEL014C 306 nt-0.18□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 snR55snR55 98 nt-0.19□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 snR65snR65 100 nt-0.2□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-0.2□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 snR49snR49 165 nt-0.2□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 YGL182CYGL182C 324 nt-0.21□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 YML099W-AYML099W-A 330 nt-0.21□□□□□ -2.44
SMT3Q12306 YER181CYER181C 324 nt-0.23□□□□□ -2.45
SMT3Q12306 STF2YGR008C 255 nt-0.23□□□□□ -2.45
SMT3Q12306 YJL182CYJL182C 318 nt-0.23□□□□□ -2.45
SMT3Q12306 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-0.24□□□□□ -2.45
SMT3Q12306 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-0.24□□□□□ -2.45
SMT3Q12306 snR45snR45 172 nt-0.26□□□□□ -2.45
SMT3Q12306 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.27□□□□□ -2.45
SMT3Q12306 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-0.27□□□□□ -2.45
SMT3Q12306 YDR210WYDR210W 228 nt-0.29□□□□□ -2.46
SMT3Q12306 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.29□□□□□ -2.46
SMT3Q12306 YOR302WYOR302W 78 nt-0.29□□□□□ -2.46
SMT3Q12306 YGR164WYGR164W 336 nt-0.3□□□□□ -2.46
SMT3Q12306 YOL014WYOL014W 375 nt-0.3□□□□□ -2.46
SMT3Q12306 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.3□□□□□ -2.46
SMT3Q12306 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.31□□□□□ -2.46
SMT3Q12306 SBH2YER019C-A 267 nt-0.32□□□□□ -2.46
SMT3Q12306 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.38□□□□□ -2.47
SMT3Q12306 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.38□□□□□ -2.47
SMT3Q12306 snR80snR80 171 nt-0.4□□□□□ -2.47
SMT3Q12306 YOR170WYOR170W 306 nt-0.4□□□□□ -2.47
SMT3Q12306 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.43□□□□□ -2.48
SMT3Q12306 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.43□□□□□ -2.48
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