Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 MSN5YDR335W 3675 nt1.28□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 UTP8YGR128C 2142 nt1.27□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 NOP9YJL010C 2001 nt1.27□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 ROM2YLR371W 4071 nt1.27□□□□□ -2.21 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR282CYLR282C 342 nt1.27□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 STB6YKL072W 2301 nt1.27□□□□□ -2.21 RIP-Chip
PUF2Q12221 CHS6YJL099W 2241 nt1.27□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 SEC3YER008C 4011 nt1.26□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 HUG1YML058W-A 207 nt1.26□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.26□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 IML1YJR138W 4755 nt1.24□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 SMC1YFL008W 3678 nt1.24□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 YLR041WYLR041W 321 nt1.24□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 ASE1YOR058C 2658 nt1.24□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 YML002WYML002W 2214 nt1.24□□□□□ -2.21 RIP-Chip
PUF2Q12221 WAR1YML076C 2835 nt1.23□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 OST4YDL232W 111 nt1.23□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 STF2YGR008C 255 nt1.23□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 NUP145YGL092W 3954 nt1.22□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 TAH1YCR060W 336 nt1.22□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.22□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 CLU1YMR012W 3834 nt1.22□□□□□ -2.21
PUF2Q12221 RPM2YML091C 3609 nt1.21□□□□□ -2.22 RIP-Chip
PUF2Q12221 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.2□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 RPL26BYGR034W 384 nt1.2□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 snR190snR190 190 nt1.2□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 YBR099CYBR099C 384 nt1.2□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.2□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 RAD9YDR217C 3930 nt1.2□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 YBR178WYBR178W 375 nt1.19□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 SIP4YJL089W 2490 nt1.18□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 FYV10YIL097W 1551 nt1.18□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 GEA2YEL022W 4380 nt1.18□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt1.18□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 QCR9YGR183C 201 nt1.18□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.18□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 NUP157YER105C 4176 nt1.18□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 snR39BsnR39B 96 nt1.17□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 KAP120YPL125W 3099 nt1.17□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 SOM1YEL059C-A 225 nt1.16□□□□□ -2.22
PUF2Q12221 YLR232WYLR232W 348 nt1.15□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 YBL109WYBL109W 336 nt1.15□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.15□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 PRP16YKR086W 3216 nt1.14□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 YDR544CYDR544C 429 nt1.14□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.14□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.14□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 PMP2YEL017C-A 132 nt1.13□□□□□ -2.23 RIP-Chip
PUF2Q12221 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.13□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 TFB5YDR079C-A 219 nt1.12□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 SEC8YPR055W 3198 nt1.12□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.11□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt1.11□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 BEM2YER155C 6504 nt1.1□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 COG6YNL041C 2520 nt1.1□□□□□ -2.23
PUF2Q12221 snR61snR61 90 nt1.08□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 YDL073WYDL073W 2955 nt1.08□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 YMR326CYMR326C 309 nt1.08□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.07□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.07□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 YDR210WYDR210W 228 nt1.06□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 NST1YNL091W 3723 nt1.05□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 SPT7YBR081C 3999 nt1.03□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.03□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 YHR217CYHR217C 462 nt1.03□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.03□□□□□ -2.24
PUF2Q12221 SEC1YDR164C 2175 nt1.03□□□□□ -2.25
PUF2Q12221 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.02□□□□□ -2.25
PUF2Q12221 RCO1YMR075W 2055 nt1.01□□□□□ -2.25
PUF2Q12221 PAU12YGR294W 363 nt1.01□□□□□ -2.25
PUF2Q12221 PAU24YBR301W 363 nt1.01□□□□□ -2.25
PUF2Q12221 YSP1YHR155W 3687 nt1.01□□□□□ -2.25
PUF2Q12221 VAM6YDL077C 3150 nt0.99□□□□□ -2.25
PUF2Q12221 SBH1YER087C-B 249 nt0.99□□□□□ -2.25
PUF2Q12221 BIR1YJR089W 2865 nt0.98□□□□□ -2.25
PUF2Q12221 BEM3YPL115C 3387 nt0.97□□□□□ -2.25
PUF2Q12221 YPR117WYPR117W 7470 nt0.96□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 ULP2YIL031W 3105 nt0.96□□□□□ -2.26 RIP-Chip
PUF2Q12221 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.95□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 RKR1YMR247C 4689 nt0.94□□□□□ -2.26 RIP-Chip
PUF2Q12221 YNL266WYNL266W 420 nt0.94□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.94□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 UBP3YER151C 2739 nt0.93□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 GLG1YKR058W 1851 nt0.92□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 NNF2YGR089W 2811 nt0.92□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.92□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 BUD3YCL014W 4911 nt0.92□□□□□ -2.26
PUF2Q12221 SCC2YDR180W 4482 nt0.89□□□□□ -2.27
PUF2Q12221 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt0.89□□□□□ -2.27
PUF2Q12221 DOP1YDR141C 5097 nt0.89□□□□□ -2.27
PUF2Q12221 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.88□□□□□ -2.27
PUF2Q12221 YJR029WYJR029W 5268 nt0.88□□□□□ -2.27
PUF2Q12221 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.88□□□□□ -2.27
PUF2Q12221 snR81snR81 201 nt0.86□□□□□ -2.27
PUF2Q12221 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 889.6 ms