Protein–RNA interactions for Protein: Q12140

BSC1, Bypass of stop codon protein 1, yeastyeast

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BSC1Q12140 NUP157YER105C 4176 nt1.1□□□□□ -2.23
BSC1Q12140 ASE1YOR058C 2658 nt1.1□□□□□ -2.23
BSC1Q12140 DOP1YDR141C 5097 nt1.1□□□□□ -2.23
BSC1Q12140 YML002WYML002W 2214 nt1.09□□□□□ -2.23
BSC1Q12140 YOR102WYOR102W 351 nt1.09□□□□□ -2.23
BSC1Q12140 snR190snR190 190 nt1.09□□□□□ -2.23
BSC1Q12140 SDH6YDR379C-A 240 nt1.08□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.08□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 IML1YJR138W 4755 nt1.08□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 SNU13YEL026W 381 nt1.07□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 SEC21YNL287W 2808 nt1.07□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 YGR130CYGR130C 2451 nt1.06□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 YGL182CYGL182C 324 nt1.06□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 FYV10YIL097W 1551 nt1.05□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 HKR1YDR420W 5409 nt1.05□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 snR48snR48 113 nt1.05□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 SIP4YJL089W 2490 nt1.05□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 KAP120YPL125W 3099 nt1.04□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 YLR041WYLR041W 321 nt1.04□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.04□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 SCC2YDR180W 4482 nt1.03□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.03□□□□□ -2.24
BSC1Q12140 TAH1YCR060W 336 nt1.02□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 SEC8YPR055W 3198 nt1.02□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.99□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.99□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 CHS6YJL099W 2241 nt0.99□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 PRP16YKR086W 3216 nt0.98□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 RAD9YDR217C 3930 nt0.98□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 SPT7YBR081C 3999 nt0.98□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.98□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 YLR232WYLR232W 348 nt0.98□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.97□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 VAM6YDL077C 3150 nt0.97□□□□□ -2.25
BSC1Q12140 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.95□□□□□ -2.26
BSC1Q12140 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.95□□□□□ -2.26
BSC1Q12140 YJR029WYJR029W 5268 nt0.94□□□□□ -2.26
BSC1Q12140 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.94□□□□□ -2.26
BSC1Q12140 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.94□□□□□ -2.26
BSC1Q12140 YDR544CYDR544C 429 nt0.92□□□□□ -2.26
BSC1Q12140 BEM3YPL115C 3387 nt0.91□□□□□ -2.26
BSC1Q12140 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.91□□□□□ -2.26
BSC1Q12140 QCR9YGR183C 201 nt0.91□□□□□ -2.26
BSC1Q12140 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.9□□□□□ -2.27
BSC1Q12140 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.9□□□□□ -2.27
BSC1Q12140 UBP3YER151C 2739 nt0.89□□□□□ -2.27
BSC1Q12140 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.89□□□□□ -2.27
BSC1Q12140 snR39BsnR39B 96 nt0.87□□□□□ -2.27
BSC1Q12140 YSP1YHR155W 3687 nt0.87□□□□□ -2.27
BSC1Q12140 YDL073WYDL073W 2955 nt0.86□□□□□ -2.27
BSC1Q12140 PAU24YBR301W 363 nt0.85□□□□□ -2.27
BSC1Q12140 COG6YNL041C 2520 nt0.85□□□□□ -2.27
BSC1Q12140 OST4YDL232W 111 nt0.84□□□□□ -2.27
BSC1Q12140 RPM2YML091C 3609 nt0.83□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.83□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 YDR210WYDR210W 228 nt0.83□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 RKR1YMR247C 4689 nt0.83□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 NST1YNL091W 3723 nt0.82□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 SOM1YEL059C-A 225 nt0.81□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 Q0143Q0143 153 nt0.81□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.8□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 SEC1YDR164C 2175 nt0.8□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.79□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 BUD3YCL014W 4911 nt0.79□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 ULP2YIL031W 3105 nt0.78□□□□□ -2.28
BSC1Q12140 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.77□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.77□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 YBR099CYBR099C 384 nt0.77□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 GLG1YKR058W 1851 nt0.77□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.75□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 NNF2YGR089W 2811 nt0.74□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.74□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BSC1Q12140 LTE1YAL024C 4308 nt0.71□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 snR85snR85 171 nt0.71□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 YNL205CYNL205C 423 nt0.71□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.69□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 STF2YGR008C 255 nt0.69□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 BIR1YJR089W 2865 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 PET111YMR257C 2403 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 BUL2YML111W 2763 nt0.67□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 NIP1YMR309C 2439 nt0.66□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 CSE1YGL238W 2883 nt0.66□□□□□ -2.3
BSC1Q12140 PMP2YEL017C-A 132 nt0.65□□□□□ -2.31
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