Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.68□□□□□ -2.68
TY1B-LR1Q12088 YFL012WYFL012W 447 nt-1.7□□□□□ -2.68
TY1B-LR1Q12088 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-1.7□□□□□ -2.68
TY1B-LR1Q12088 YOR170WYOR170W 306 nt-1.7□□□□□ -2.68
TY1B-LR1Q12088 CBS1YDL069C 690 nt-1.7□□□□□ -2.68
TY1B-LR1Q12088 YER053C-AYER053C-A 114 nt-1.7□□□□□ -2.68
TY1B-LR1Q12088 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.7□□□□□ -2.68
TY1B-LR1Q12088 YBR285WYBR285W 435 nt-1.71□□□□□ -2.68
TY1B-LR1Q12088 YLR456WYLR456W 615 nt-1.72□□□□□ -2.68
TY1B-LR1Q12088 snR81snR81 201 nt-1.72□□□□□ -2.69
TY1B-LR1Q12088 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.72□□□□□ -2.69
TY1B-LR1Q12088 snR74snR74 88 nt-1.75□□□□□ -2.69
TY1B-LR1Q12088 VPS20YMR077C 666 nt-1.75□□□□□ -2.69
TY1B-LR1Q12088 YOR121CYOR121C 306 nt-1.76□□□□□ -2.69
TY1B-LR1Q12088 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.77□□□□□ -2.69
TY1B-LR1Q12088 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-1.78□□□□□ -2.69
TY1B-LR1Q12088 YER090C-AYER090C-A 90 nt-1.83□□□□□ -2.7
TY1B-LR1Q12088 YHR125WYHR125W 306 nt-1.84□□□□□ -2.7
TY1B-LR1Q12088 JLP2YMR132C 627 nt-1.84□□□□□ -2.7
TY1B-LR1Q12088 YDL016CYDL016C 303 nt-1.85□□□□□ -2.7
TY1B-LR1Q12088 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.85□□□□□ -2.7
TY1B-LR1Q12088 RPS27BYHR021C 249 nt-1.85□□□□□ -2.7
TY1B-LR1Q12088 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-1.85□□□□□ -2.7
TY1B-LR1Q12088 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-1.85□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 YIL029CYIL029C 429 nt-1.85□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 YGR069WYGR069W 336 nt-1.86□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 PCC1YKR095W-A 267 nt-1.86□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 TOM22YNL131W 459 nt-1.86□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 snR77snR77 88 nt-1.87□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 GPI15YNL038W 690 nt-1.89□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 YAF9YNL107W 681 nt-1.89□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 PRM3YPL192C 402 nt-1.89□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-1.9□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 CSE2YNR010W 450 nt-1.9□□□□□ -2.71
TY1B-LR1Q12088 BI2Q0110 1272 nt-1.92□□□□□ -2.72
TY1B-LR1Q12088 YAR047CYAR047C 321 nt-1.92□□□□□ -2.72
TY1B-LR1Q12088 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-1.93□□□□□ -2.72
TY1B-LR1Q12088 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-1.95□□□□□ -2.72
TY1B-LR1Q12088 YNL205CYNL205C 423 nt-1.97□□□□□ -2.72
TY1B-LR1Q12088 RDS3YPR094W 324 nt-1.97□□□□□ -2.72
TY1B-LR1Q12088 YDR543CYDR543C 300 nt-1.98□□□□□ -2.73
TY1B-LR1Q12088 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-1.98□□□□□ -2.73
TY1B-LR1Q12088 YNL266WYNL266W 420 nt-1.98□□□□□ -2.73
TY1B-LR1Q12088 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-1.98□□□□□ -2.73
TY1B-LR1Q12088 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-1.98□□□□□ -2.73
TY1B-LR1Q12088 YDR544CYDR544C 429 nt-1.99□□□□□ -2.73
TY1B-LR1Q12088 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-2□□□□□ -2.73
TY1B-LR1Q12088 YGL149WYGL149W 306 nt-2.02□□□□□ -2.73
TY1B-LR1Q12088 Q0142Q0142 177 nt-2.03□□□□□ -2.73
TY1B-LR1Q12088 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-2.05□□□□□ -2.74
TY1B-LR1Q12088 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-2.05□□□□□ -2.74
TY1B-LR1Q12088 YLR202CYLR202C 327 nt-2.05□□□□□ -2.74
TY1B-LR1Q12088 snR39BsnR39B 96 nt-2.09□□□□□ -2.74
TY1B-LR1Q12088 EAF6YJR082C 342 nt-2.1□□□□□ -2.75
TY1B-LR1Q12088 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-2.12□□□□□ -2.75
TY1B-LR1Q12088 YML054C-AYML054C-A 159 nt-2.13□□□□□ -2.75
TY1B-LR1Q12088 snR54snR54 86 nt-2.13□□□□□ -2.75
TY1B-LR1Q12088 YLR269CYLR269C 351 nt-2.14□□□□□ -2.75
TY1B-LR1Q12088 snR50snR50 90 nt-2.15□□□□□ -2.75
TY1B-LR1Q12088 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-2.17□□□□□ -2.76
TY1B-LR1Q12088 YDR048CYDR048C 315 nt-2.22□□□□□ -2.76
TY1B-LR1Q12088 HMRA1YCR097W 381 nt-2.23□□□□□ -2.77
TY1B-LR1Q12088 YKL063CYKL063C 504 nt-2.23□□□□□ -2.77
TY1B-LR1Q12088 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-2.23□□□□□ -2.77
TY1B-LR1Q12088 YER006C-AYER006C-A 318 nt-2.26□□□□□ -2.77
TY1B-LR1Q12088 snR67snR67 82 nt-2.26□□□□□ -2.77
TY1B-LR1Q12088 MPC1YGL080W 393 nt-2.26□□□□□ -2.77
TY1B-LR1Q12088 snR69snR69 101 nt-2.28□□□□□ -2.77
TY1B-LR1Q12088 YER137W-AYER137W-A 306 nt-2.28□□□□□ -2.77
TY1B-LR1Q12088 YOR309CYOR309C 381 nt-2.28□□□□□ -2.77
TY1B-LR1Q12088 YDR102CYDR102C 333 nt-2.28□□□□□ -2.78
TY1B-LR1Q12088 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-2.29□□□□□ -2.78
TY1B-LR1Q12088 YML099W-AYML099W-A 330 nt-2.31□□□□□ -2.78
TY1B-LR1Q12088 YAL066WYAL066W 309 nt-2.32□□□□□ -2.78
TY1B-LR1Q12088 YDL158CYDL158C 309 nt-2.33□□□□□ -2.78
TY1B-LR1Q12088 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-2.33□□□□□ -2.78
TY1B-LR1Q12088 CSN9YDR179C 489 nt-2.34□□□□□ -2.78
TY1B-LR1Q12088 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-2.35□□□□□ -2.79
TY1B-LR1Q12088 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-2.38□□□□□ -2.79
TY1B-LR1Q12088 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-2.38□□□□□ -2.79
TY1B-LR1Q12088 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-2.41□□□□□ -2.79
TY1B-LR1Q12088 YER097WYER097W 330 nt-2.42□□□□□ -2.8
TY1B-LR1Q12088 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-2.44□□□□□ -2.8
TY1B-LR1Q12088 YFL032WYFL032W 321 nt-2.45□□□□□ -2.8
TY1B-LR1Q12088 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-2.46□□□□□ -2.8
TY1B-LR1Q12088 YNL028WYNL028W 318 nt-2.49□□□□□ -2.81
TY1B-LR1Q12088 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-2.49□□□□□ -2.81
TY1B-LR1Q12088 YFL019CYFL019C 354 nt-2.51□□□□□ -2.81
TY1B-LR1Q12088 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-2.51□□□□□ -2.81
TY1B-LR1Q12088 snR60snR60 104 nt-2.53□□□□□ -2.81
TY1B-LR1Q12088 YNL324WYNL324W 396 nt-2.54□□□□□ -2.82
TY1B-LR1Q12088 YPR197CYPR197C 564 nt-2.56□□□□□ -2.82
TY1B-LR1Q12088 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-2.59□□□□□ -2.82
TY1B-LR1Q12088 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-2.59□□□□□ -2.82
TY1B-LR1Q12088 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-2.6□□□□□ -2.83
TY1B-LR1Q12088 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-2.6□□□□□ -2.83
TY1B-LR1Q12088 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-2.61□□□□□ -2.83
TY1B-LR1Q12088 ATP19YOL077W-A 207 nt-2.61□□□□□ -2.83
TY1B-LR1Q12088 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-2.61□□□□□ -2.83
TY1B-LR1Q12088 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-2.62□□□□□ -2.83
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