Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.89□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.88□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 COY1YKL179C 2040 nt0.88□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 YKU70YMR284W 1809 nt0.87□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 TRS65YGR166W 1683 nt0.86□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 snR190snR190 190 nt0.86□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 COX12YLR038C 252 nt0.84□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.84□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.84□□□□□ -2.27
CTI6Q08923 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.83□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 CHS6YJL099W 2241 nt0.83□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 UTP8YGR128C 2142 nt0.82□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.82□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 YLR282CYLR282C 342 nt0.81□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 ULI1YFR026C 510 nt0.8□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 APQ12YIL040W 417 nt0.8□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 JLP2YMR132C 627 nt0.8□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 FYV10YIL097W 1551 nt0.79□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 YEL014CYEL014C 306 nt0.79□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.79□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.79□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 COX5BYIL111W 456 nt0.79□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 YML002WYML002W 2214 nt0.79□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 HAL9YOL089C 3093 nt0.78□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.78□□□□□ -2.28
CTI6Q08923 BLI1YKL061W 342 nt0.77□□□□□ -2.29
CTI6Q08923 PRP5YBR237W 2550 nt0.77□□□□□ -2.29
CTI6Q08923 LTE1YAL024C 4308 nt0.76□□□□□ -2.29
CTI6Q08923 SPG3YDR504C 384 nt0.76□□□□□ -2.29
CTI6Q08923 YJL182CYJL182C 318 nt0.73□□□□□ -2.29
CTI6Q08923 OST4YDL232W 111 nt0.72□□□□□ -2.29
CTI6Q08923 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.72□□□□□ -2.29
CTI6Q08923 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.72□□□□□ -2.29
CTI6Q08923 PRP42YDR235W 1635 nt0.71□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.71□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.71□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 ULP2YIL031W 3105 nt0.71□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 BIR1YJR089W 2865 nt0.7□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 YLR041WYLR041W 321 nt0.7□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 BEM3YPL115C 3387 nt0.69□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 YJL150WYJL150W 303 nt0.69□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 PRP39YML046W 1890 nt0.69□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 snR46snR46 197 nt0.68□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 FMP27YLR454W 7887 nt0.68□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 AI1Q0050 2505 nt0.68□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 snR52snR52 92 nt0.67□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 YNL198CYNL198C 303 nt0.66□□□□□ -2.3
CTI6Q08923 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 PET111YMR257C 2403 nt0.64□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 YSP1YHR155W 3687 nt0.63□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 YDR544CYDR544C 429 nt0.63□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 UTP10YJL109C 5310 nt0.62□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 TAH1YCR060W 336 nt0.62□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt0.62□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.61□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt0.6□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 YBL053WYBL053W 375 nt0.6□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 SNU13YEL026W 381 nt0.59□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.59□□□□□ -2.31
CTI6Q08923 BUL2YML111W 2763 nt0.58□□□□□ -2.32
CTI6Q08923 MLP1YKR095W 5628 nt0.58□□□□□ -2.32
CTI6Q08923 NNF2YGR089W 2811 nt0.57□□□□□ -2.32
CTI6Q08923 YGL182CYGL182C 324 nt0.57□□□□□ -2.32
CTI6Q08923 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.55□□□□□ -2.32
CTI6Q08923 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.55□□□□□ -2.32
CTI6Q08923 ORC3YLL004W 1851 nt0.54□□□□□ -2.32
CTI6Q08923 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt0.54□□□□□ -2.32
CTI6Q08923 SBH1YER087C-B 249 nt0.52□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 YLR232WYLR232W 348 nt0.52□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.5□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 SDH6YDR379C-A 240 nt0.5□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 YEL073CYEL073C 324 nt0.5□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 RPS26AYGL189C 360 nt0.5□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.5□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.5□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.5□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.49□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 snR39BsnR39B 96 nt0.49□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.48□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 NIP1YMR309C 2439 nt0.48□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 IQG1YPL242C 4488 nt0.47□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.47□□□□□ -2.33
CTI6Q08923 COG6YNL041C 2520 nt0.46□□□□□ -2.34
CTI6Q08923 YGR151CYGR151C 336 nt0.46□□□□□ -2.34
CTI6Q08923 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.46□□□□□ -2.34
CTI6Q08923 YNL338WYNL338W 159 nt0.45□□□□□ -2.34
CTI6Q08923 YOR170WYOR170W 306 nt0.43□□□□□ -2.34
CTI6Q08923 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt0.42□□□□□ -2.34
CTI6Q08923 GLG1YKR058W 1851 nt0.4□□□□□ -2.35
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