Protein–RNA interactions for Protein: Q08235

BRX1, Ribosome biogenesis protein BRX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1Q08235 YLR434CYLR434C 384 nt-0.62□□□□□ -2.51
BRX1Q08235 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.64□□□□□ -2.51
BRX1Q08235 YFL063WYFL063W 456 nt-0.64□□□□□ -2.51
BRX1Q08235 RPS27BYHR021C 249 nt-0.64□□□□□ -2.51
BRX1Q08235 CSE2YNR010W 450 nt-0.64□□□□□ -2.51
BRX1Q08235 AGA2YGL032C 264 nt-0.67□□□□□ -2.52
BRX1Q08235 snR33snR33 183 nt-0.67□□□□□ -2.52
BRX1Q08235 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
BRX1Q08235 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
BRX1Q08235 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
BRX1Q08235 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.68□□□□□ -2.52
BRX1Q08235 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.69□□□□□ -2.52
BRX1Q08235 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-0.7□□□□□ -2.52
BRX1Q08235 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.73□□□□□ -2.53
BRX1Q08235 YGR069WYGR069W 336 nt-0.74□□□□□ -2.53
BRX1Q08235 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-0.75□□□□□ -2.53
BRX1Q08235 YER079WYER079W 633 nt-0.75□□□□□ -2.53
BRX1Q08235 YKL063CYKL063C 504 nt-0.75□□□□□ -2.53
BRX1Q08235 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-0.75□□□□□ -2.53
BRX1Q08235 SDH6YDR379C-A 240 nt-0.76□□□□□ -2.53
BRX1Q08235 YER053C-AYER053C-A 114 nt-0.76□□□□□ -2.53
BRX1Q08235 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-0.77□□□□□ -2.53
BRX1Q08235 ATP19YOL077W-A 207 nt-0.77□□□□□ -2.53
BRX1Q08235 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.79□□□□□ -2.54
BRX1Q08235 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-0.79□□□□□ -2.54
BRX1Q08235 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.8□□□□□ -2.54
BRX1Q08235 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-0.8□□□□□ -2.54
BRX1Q08235 YLR202CYLR202C 327 nt-0.8□□□□□ -2.54
BRX1Q08235 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.81□□□□□ -2.54
BRX1Q08235 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.82□□□□□ -2.54
BRX1Q08235 snR161snR161 161 nt-0.83□□□□□ -2.54
BRX1Q08235 COG6YNL041C 2520 nt-0.85□□□□□ -2.55
BRX1Q08235 YDR048CYDR048C 315 nt-0.85□□□□□ -2.55
BRX1Q08235 YOR121CYOR121C 306 nt-0.86□□□□□ -2.55
BRX1Q08235 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-0.86□□□□□ -2.55
BRX1Q08235 YER137W-AYER137W-A 306 nt-0.87□□□□□ -2.55
BRX1Q08235 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.87□□□□□ -2.55
BRX1Q08235 YOR170WYOR170W 306 nt-0.87□□□□□ -2.55
BRX1Q08235 APQ12YIL040W 417 nt-0.89□□□□□ -2.55
BRX1Q08235 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.89□□□□□ -2.55
BRX1Q08235 YDL158CYDL158C 309 nt-0.9□□□□□ -2.55
BRX1Q08235 YDR544CYDR544C 429 nt-0.91□□□□□ -2.56
BRX1Q08235 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-0.91□□□□□ -2.56
BRX1Q08235 HMRA1YCR097W 381 nt-0.92□□□□□ -2.56
BRX1Q08235 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-0.92□□□□□ -2.56
BRX1Q08235 snR36snR36 182 nt-0.92□□□□□ -2.56
BRX1Q08235 BIL1YOR304C-A 231 nt-0.93□□□□□ -2.56
BRX1Q08235 YBR285WYBR285W 435 nt-0.93□□□□□ -2.56
BRX1Q08235 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.94□□□□□ -2.56
BRX1Q08235 YJL182CYJL182C 318 nt-0.94□□□□□ -2.56
BRX1Q08235 snR60snR60 104 nt-0.96□□□□□ -2.56
BRX1Q08235 YGL052WYGL052W 306 nt-0.98□□□□□ -2.57
BRX1Q08235 snR189snR189 189 nt-0.98□□□□□ -2.57
BRX1Q08235 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.99□□□□□ -2.57
BRX1Q08235 snR49snR49 165 nt-0.99□□□□□ -2.57
BRX1Q08235 YGL182CYGL182C 324 nt-1□□□□□ -2.57
BRX1Q08235 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-1.01□□□□□ -2.57
BRX1Q08235 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-1.01□□□□□ -2.57
BRX1Q08235 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.05□□□□□ -2.58
BRX1Q08235 HTL1YCR020W-B 237 nt-1.06□□□□□ -2.58
BRX1Q08235 YGL149WYGL149W 306 nt-1.06□□□□□ -2.58
BRX1Q08235 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt-1.06□□□□□ -2.58
BRX1Q08235 YNL028WYNL028W 318 nt-1.06□□□□□ -2.58
BRX1Q08235 YIL032CYIL032C 357 nt-1.07□□□□□ -2.58
BRX1Q08235 YNL324WYNL324W 396 nt-1.07□□□□□ -2.58
BRX1Q08235 JLP2YMR132C 627 nt-1.09□□□□□ -2.58
BRX1Q08235 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-1.1□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 YML099W-AYML099W-A 330 nt-1.1□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 YOR015WYOR015W 360 nt-1.1□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-1.1□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 snR74snR74 88 nt-1.12□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 YGR035CYGR035C 351 nt-1.12□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt-1.12□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt-1.13□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 YAF9YNL107W 681 nt-1.13□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 snR50snR50 90 nt-1.13□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 SKI7YOR076C 2244 nt-1.13□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 YNL266WYNL266W 420 nt-1.14□□□□□ -2.59
BRX1Q08235 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-1.16□□□□□ -2.6
BRX1Q08235 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-1.18□□□□□ -2.6
BRX1Q08235 YNR077CYNR077C 255 nt-1.19□□□□□ -2.6
BRX1Q08235 snR69snR69 101 nt-1.21□□□□□ -2.6
BRX1Q08235 ATP6Q0085 780 nt-1.21□□□□□ -2.6
BRX1Q08235 YER090C-AYER090C-A 90 nt-1.21□□□□□ -2.6
BRX1Q08235 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-1.22□□□□□ -2.6
BRX1Q08235 YDR102CYDR102C 333 nt-1.28□□□□□ -2.61
BRX1Q08235 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.28□□□□□ -2.61
BRX1Q08235 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-1.28□□□□□ -2.61
BRX1Q08235 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-1.29□□□□□ -2.62
BRX1Q08235 YJR157WYJR157W 363 nt-1.29□□□□□ -2.62
BRX1Q08235 YFL032WYFL032W 321 nt-1.31□□□□□ -2.62
BRX1Q08235 YFL019CYFL019C 354 nt-1.32□□□□□ -2.62
BRX1Q08235 snR77snR77 88 nt-1.33□□□□□ -2.62
BRX1Q08235 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.33□□□□□ -2.62
BRX1Q08235 YNL205CYNL205C 423 nt-1.33□□□□□ -2.62
BRX1Q08235 RDS3YPR094W 324 nt-1.33□□□□□ -2.62
BRX1Q08235 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-1.36□□□□□ -2.63
BRX1Q08235 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.37□□□□□ -2.63
BRX1Q08235 snR67snR67 82 nt-1.38□□□□□ -2.63
BRX1Q08235 snR39BsnR39B 96 nt-1.39□□□□□ -2.63
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