Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 PRP42YDR235W 1635 nt1.42□□□□□ -2.18
NSE3Q05541 BFR2YDR299W 1605 nt1.42□□□□□ -2.18
NSE3Q05541 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.42□□□□□ -2.18
NSE3Q05541 TRS65YGR166W 1683 nt1.42□□□□□ -2.18
NSE3Q05541 NST1YNL091W 3723 nt1.41□□□□□ -2.18
NSE3Q05541 PRP5YBR237W 2550 nt1.41□□□□□ -2.18
NSE3Q05541 PRP16YKR086W 3216 nt1.38□□□□□ -2.19
NSE3Q05541 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.38□□□□□ -2.19
NSE3Q05541 SPT7YBR081C 3999 nt1.38□□□□□ -2.19
NSE3Q05541 FYV10YIL097W 1551 nt1.36□□□□□ -2.19
NSE3Q05541 YLR041WYLR041W 321 nt1.36□□□□□ -2.19
NSE3Q05541 YLR294CYLR294C 330 nt1.35□□□□□ -2.19
NSE3Q05541 YNL338WYNL338W 159 nt1.35□□□□□ -2.19
NSE3Q05541 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.33□□□□□ -2.2
NSE3Q05541 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.33□□□□□ -2.2
NSE3Q05541 YGL182CYGL182C 324 nt1.27□□□□□ -2.21
NSE3Q05541 SCC2YDR180W 4482 nt1.26□□□□□ -2.21
NSE3Q05541 UBP3YER151C 2739 nt1.25□□□□□ -2.21
NSE3Q05541 TAH1YCR060W 336 nt1.25□□□□□ -2.21
NSE3Q05541 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.25□□□□□ -2.21
NSE3Q05541 YLR232WYLR232W 348 nt1.25□□□□□ -2.21
NSE3Q05541 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.24□□□□□ -2.21
NSE3Q05541 YPR117WYPR117W 7470 nt1.22□□□□□ -2.21
NSE3Q05541 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.22□□□□□ -2.21
NSE3Q05541 YOR170WYOR170W 306 nt1.22□□□□□ -2.21
NSE3Q05541 YSP1YHR155W 3687 nt1.21□□□□□ -2.22
NSE3Q05541 YOR102WYOR102W 351 nt1.2□□□□□ -2.22
NSE3Q05541 BEM3YPL115C 3387 nt1.2□□□□□ -2.22
NSE3Q05541 RPM2YML091C 3609 nt1.19□□□□□ -2.22
NSE3Q05541 SNU13YEL026W 381 nt1.19□□□□□ -2.22
NSE3Q05541 snR48snR48 113 nt1.19□□□□□ -2.22
NSE3Q05541 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.18□□□□□ -2.22
NSE3Q05541 YJR029WYJR029W 5268 nt1.17□□□□□ -2.22
NSE3Q05541 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.17□□□□□ -2.22
NSE3Q05541 YDL073WYDL073W 2955 nt1.16□□□□□ -2.22
NSE3Q05541 OST4YDL232W 111 nt1.15□□□□□ -2.23
NSE3Q05541 CHS6YJL099W 2241 nt1.14□□□□□ -2.23
NSE3Q05541 PAU12YGR294W 363 nt1.13□□□□□ -2.23
NSE3Q05541 PAU24YBR301W 363 nt1.13□□□□□ -2.23
NSE3Q05541 LTE1YAL024C 4308 nt1.13□□□□□ -2.23
NSE3Q05541 BEM2YER155C 6504 nt1.12□□□□□ -2.23
NSE3Q05541 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.11□□□□□ -2.23
NSE3Q05541 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.1□□□□□ -2.23
NSE3Q05541 RKR1YMR247C 4689 nt1.09□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 VAM6YDL077C 3150 nt1.08□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 UTP20YBL004W 7482 nt1.07□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.07□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.07□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.07□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.06□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 YDR544CYDR544C 429 nt1.06□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.05□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.04□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.04□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 YBL053WYBL053W 375 nt1.04□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 SEC1YDR164C 2175 nt1.04□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 ULP2YIL031W 3105 nt1.03□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 COG6YNL041C 2520 nt1.03□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.03□□□□□ -2.24
NSE3Q05541 QCR9YGR183C 201 nt1.02□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.02□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.01□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.01□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.01□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.01□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.01□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.01□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 GLG1YKR058W 1851 nt1.01□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 NNF2YGR089W 2811 nt1□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 YGR164WYGR164W 336 nt0.98□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.97□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 YMR160WYMR160W 2451 nt0.97□□□□□ -2.25
NSE3Q05541 SDH6YDR379C-A 240 nt0.96□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.94□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 snR39BsnR39B 96 nt0.94□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 DOP1YDR141C 5097 nt0.94□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 PET111YMR257C 2403 nt0.93□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 YDR210WYDR210W 228 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 BUD3YCL014W 4911 nt0.91□□□□□ -2.26
NSE3Q05541 ATP8Q0080 147 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE3Q05541 MLP1YKR095W 5628 nt0.89□□□□□ -2.27
NSE3Q05541 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.88□□□□□ -2.27
NSE3Q05541 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.88□□□□□ -2.27
NSE3Q05541 NIP1YMR309C 2439 nt0.87□□□□□ -2.27
NSE3Q05541 Q0092Q0092 141 nt0.87□□□□□ -2.27
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