Protein–RNA interactions for Protein: Q04978

YML053C, Uncharacterized protein YML053C, yeastyeast

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML053CQ04978 PRP42YDR235W 1635 nt1.26□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 HKR1YDR420W 5409 nt1.26□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 DOP1YDR141C 5097 nt1.25□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 STB6YKL072W 2301 nt1.25□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.25□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 YLR282CYLR282C 342 nt1.25□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 BFR2YDR299W 1605 nt1.25□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 Q0092Q0092 141 nt1.24□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 ASE1YOR058C 2658 nt1.24□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 PRP5YBR237W 2550 nt1.23□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 SIP4YJL089W 2490 nt1.23□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.23□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 CDC39YCR093W 6327 nt1.23□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 YML002WYML002W 2214 nt1.23□□□□□ -2.21
YML053CQ04978 SNU13YEL026W 381 nt1.21□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 PRP16YKR086W 3216 nt1.21□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 ATP8Q0080 147 nt1.2□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 UTP8YGR128C 2142 nt1.2□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 YOR170WYOR170W 306 nt1.2□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 snR190snR190 190 nt1.2□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.19□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 YLR041WYLR041W 321 nt1.19□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 GEA2YEL022W 4380 nt1.19□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 RPM2YML091C 3609 nt1.18□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 UTP20YBL004W 7482 nt1.18□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 SEC8YPR055W 3198 nt1.17□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 snR48snR48 113 nt1.17□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 UBP3YER151C 2739 nt1.17□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.16□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 YOR102WYOR102W 351 nt1.16□□□□□ -2.22
YML053CQ04978 YGL182CYGL182C 324 nt1.15□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 YGR164WYGR164W 336 nt1.15□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 YOL014WYOL014W 375 nt1.15□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 SEC21YNL287W 2808 nt1.15□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 FYV10YIL097W 1551 nt1.14□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.14□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 YNL170WYNL170W 396 nt1.13□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 RAD9YDR217C 3930 nt1.12□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 SDH6YDR379C-A 240 nt1.12□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.12□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.12□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 YBL053WYBL053W 375 nt1.11□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 BUD3YCL014W 4911 nt1.1□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.1□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.1□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 TAH1YCR060W 336 nt1.09□□□□□ -2.23
YML053CQ04978 YLR232WYLR232W 348 nt1.08□□□□□ -2.24
YML053CQ04978 NST1YNL091W 3723 nt1.06□□□□□ -2.24
YML053CQ04978 CHS6YJL099W 2241 nt1.06□□□□□ -2.24
YML053CQ04978 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.06□□□□□ -2.24
YML053CQ04978 SPT7YBR081C 3999 nt1.05□□□□□ -2.24
YML053CQ04978 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.04□□□□□ -2.24
YML053CQ04978 VAM6YDL077C 3150 nt1.02□□□□□ -2.25
YML053CQ04978 YSP1YHR155W 3687 nt1.02□□□□□ -2.25
YML053CQ04978 BEM2YER155C 6504 nt1.01□□□□□ -2.25
YML053CQ04978 YDL073WYDL073W 2955 nt1□□□□□ -2.25
YML053CQ04978 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1□□□□□ -2.25
YML053CQ04978 BIR1YJR089W 2865 nt1□□□□□ -2.25
YML053CQ04978 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.99□□□□□ -2.25
YML053CQ04978 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.99□□□□□ -2.25
YML053CQ04978 SCC2YDR180W 4482 nt0.97□□□□□ -2.25
YML053CQ04978 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.97□□□□□ -2.25
YML053CQ04978 YMR160WYMR160W 2451 nt0.96□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 BEM3YPL115C 3387 nt0.96□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.95□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 OST4YDL232W 111 nt0.94□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.94□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 COG6YNL041C 2520 nt0.93□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 YJR029WYJR029W 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 YDR544CYDR544C 429 nt0.93□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 ULP2YIL031W 3105 nt0.93□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 LTE1YAL024C 4308 nt0.92□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 snR39BsnR39B 96 nt0.91□□□□□ -2.26
YML053CQ04978 YPR117WYPR117W 7470 nt0.9□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.89□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.89□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 GLG1YKR058W 1851 nt0.88□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.87□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 SEC1YDR164C 2175 nt0.86□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 YDR210WYDR210W 228 nt0.86□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.86□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 RKR1YMR247C 4689 nt0.85□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 SOM1YEL059C-A 225 nt0.84□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.84□□□□□ -2.27
YML053CQ04978 NNF2YGR089W 2811 nt0.82□□□□□ -2.28
YML053CQ04978 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.81□□□□□ -2.28
YML053CQ04978 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.79□□□□□ -2.28
YML053CQ04978 Q0143Q0143 153 nt0.78□□□□□ -2.28
YML053CQ04978 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.78□□□□□ -2.28
YML053CQ04978 BUL2YML111W 2763 nt0.77□□□□□ -2.29
YML053CQ04978 YNL205CYNL205C 423 nt0.77□□□□□ -2.29
YML053CQ04978 YBR099CYBR099C 384 nt0.77□□□□□ -2.29
YML053CQ04978 NIP1YMR309C 2439 nt0.75□□□□□ -2.29
YML053CQ04978 IQG1YPL242C 4488 nt0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.5 ms