Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PKR1	Q03880	YIL002W-A	YIL002W-A	210 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
PKR1	Q03880	YFL063W	YFL063W	456 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
PKR1	Q03880	snR36	snR36	182 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
PKR1	Q03880	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
PKR1	Q03880	YER053C-A	YER053C-A	114 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
PKR1	Q03880	BI2	Q0110	1272 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
PKR1	Q03880	VPS20	YMR077C	666 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	YKL123W	YKL123W	381 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	YLR154W-F	YLR154W-F	141 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	YJL182C	YJL182C	318 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	CSN9	YDR179C	489 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	snR161	snR161	161 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	YDR544C	YDR544C	429 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	RPS27B	YHR021C	249 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	APQ12	YIL040W	417 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	YMR193C-A	YMR193C-A	387 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	snR49	snR49	165 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
PKR1	Q03880	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
PKR1	Q03880	YGR069W	YGR069W	336 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
PKR1	Q03880	STE18	YJR086W	333 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
PKR1	Q03880	YGL052W	YGL052W	306 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
PKR1	Q03880	YLL019W-A	YLL019W-A	93 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
PKR1	Q03880	YOR170W	YOR170W	306 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
PKR1	Q03880	YGL182C	YGL182C	324 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
PKR1	Q03880	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
PKR1	Q03880	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
PKR1	Q03880	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
PKR1	Q03880	TOM22	YNL131W	459 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
PKR1	Q03880	CSE2	YNR010W	450 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
PKR1	Q03880	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
PKR1	Q03880	YNL122C	YNL122C	348 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
PKR1	Q03880	snR41	snR41	95 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
PKR1	Q03880	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
PKR1	Q03880	TAH1	YCR060W	336 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
PKR1	Q03880	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
PKR1	Q03880	tQ(UUG)Q	tQ(UUG)Q	76 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
PKR1	Q03880	HMRA1	YCR097W	381 nt		-1.4	□□□□□ -2.63
PKR1	Q03880	YLR434C	YLR434C	384 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
PKR1	Q03880	YAF9	YNL107W	681 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
PKR1	Q03880	YJL077W-A	YJL077W-A	87 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
PKR1	Q03880	YML099W-A	YML099W-A	330 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
PKR1	Q03880	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
PKR1	Q03880	snR74	snR74	88 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
PKR1	Q03880	YOR015W	YOR015W	360 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
PKR1	Q03880	YER137W-A	YER137W-A	306 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
PKR1	Q03880	YDR048C	YDR048C	315 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
PKR1	Q03880	JLP2	YMR132C	627 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
PKR1	Q03880	YOR072W-B	YOR072W-B	162 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
PKR1	Q03880	YOR314W-A	YOR314W-A	111 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
PKR1	Q03880	snR50	snR50	90 nt		-1.5	□□□□□ -2.65
PKR1	Q03880	YIL032C	YIL032C	357 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
PKR1	Q03880	YNL266W	YNL266W	420 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
PKR1	Q03880	YGL149W	YGL149W	306 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
PKR1	Q03880	YER090C-A	YER090C-A	90 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
PKR1	Q03880	YBL039C-A	YBL039C-A	84 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
PKR1	Q03880	SKI7	YOR076C	2244 nt		-1.54	□□□□□ -2.66
PKR1	Q03880	snR60	snR60	104 nt		-1.54	□□□□□ -2.66
PKR1	Q03880	snR189	snR189	189 nt		-1.54	□□□□□ -2.66
PKR1	Q03880	snR69	snR69	101 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
PKR1	Q03880	YDL158C	YDL158C	309 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
PKR1	Q03880	YNR025C	YNR025C	360 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
PKR1	Q03880	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
PKR1	Q03880	YDR102C	YDR102C	333 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
PKR1	Q03880	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
PKR1	Q03880	YOR121C	YOR121C	306 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
PKR1	Q03880	YLR406C-A	YLR406C-A	150 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
PKR1	Q03880	YBR285W	YBR285W	435 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
PKR1	Q03880	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
PKR1	Q03880	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
PKR1	Q03880	RDS3	YPR094W	324 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
PKR1	Q03880	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		-1.68	□□□□□ -2.68
PKR1	Q03880	YNL324W	YNL324W	396 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
PKR1	Q03880	YFL032W	YFL032W	321 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
PKR1	Q03880	snR67	snR67	82 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	YNL028W	YNL028W	318 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	ATP6	Q0085	780 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	snR78	snR78	87 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	YER097W	YER097W	330 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	YLR202C	YLR202C	327 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	YNL205C	YNL205C	423 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	ATP19	YOL077W-A	207 nt		-1.78	□□□□□ -2.69
PKR1	Q03880	YFL019C	YFL019C	354 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
PKR1	Q03880	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
PKR1	Q03880	BIL1	YOR304C-A	231 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
PKR1	Q03880	snR77	snR77	88 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
PKR1	Q03880	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
PKR1	Q03880	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
PKR1	Q03880	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.81	□□□□□ -2.7
PKR1	Q03880	YGL041C	YGL041C	204 nt		-1.85	□□□□□ -2.71
PKR1	Q03880	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.85	□□□□□ -2.71
PKR1	Q03880	snR39B	snR39B	96 nt		-1.85	□□□□□ -2.71
PKR1	Q03880	HTL1	YCR020W-B	237 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
PKR1	Q03880	YKL063C	YKL063C	504 nt		-1.87	□□□□□ -2.71
PKR1	Q03880	snR81	snR81	201 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
PKR1	Q03880	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
PKR1	Q03880	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-1.88	□□□□□ -2.71
PKR1	Q03880	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-1.89	□□□□□ -2.71

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.6 ms