Protein–RNA interactions for Protein: P53394

YPR003C, Putative sulfate transporter YPR003C, yeastyeast

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR003CP53394 RAD9YDR217C 3930 nt1.17□□□□□ -2.22
YPR003CP53394 BFR2YDR299W 1605 nt1.16□□□□□ -2.22
YPR003CP53394 Q0092Q0092 141 nt1.16□□□□□ -2.22
YPR003CP53394 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.16□□□□□ -2.22
YPR003CP53394 snR190snR190 190 nt1.16□□□□□ -2.22
YPR003CP53394 SPT7YBR081C 3999 nt1.15□□□□□ -2.22
YPR003CP53394 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.15□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.15□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 CDC39YCR093W 6327 nt1.14□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 SNU13YEL026W 381 nt1.13□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 YOR170WYOR170W 306 nt1.13□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 SEC8YPR055W 3198 nt1.11□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 YOR102WYOR102W 351 nt1.11□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 FYV10YIL097W 1551 nt1.11□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 ATP8Q0080 147 nt1.1□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 YGL182CYGL182C 324 nt1.1□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 ASE1YOR058C 2658 nt1.1□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 YJR029WYJR029W 5268 nt1.09□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 YLR041WYLR041W 321 nt1.09□□□□□ -2.23
YPR003CP53394 BUD3YCL014W 4911 nt1.07□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 YGR164WYGR164W 336 nt1.07□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.07□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 snR48snR48 113 nt1.07□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 PRP16YKR086W 3216 nt1.07□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 KAP120YPL125W 3099 nt1.06□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 TAH1YCR060W 336 nt1.06□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.06□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 YBL053WYBL053W 375 nt1.06□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 YLR232WYLR232W 348 nt1.05□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 YNL170WYNL170W 396 nt1.05□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.05□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 CHS6YJL099W 2241 nt1.04□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 BEM2YER155C 6504 nt1.04□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 STF2YGR008C 255 nt1.04□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 VAM6YDL077C 3150 nt1.03□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.03□□□□□ -2.24
YPR003CP53394 NST1YNL091W 3723 nt1.03□□□□□ -2.25
YPR003CP53394 SDH6YDR379C-A 240 nt1.02□□□□□ -2.25
YPR003CP53394 BEM3YPL115C 3387 nt1.01□□□□□ -2.25
YPR003CP53394 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1□□□□□ -2.25
YPR003CP53394 DOP1YDR141C 5097 nt1□□□□□ -2.25
YPR003CP53394 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt0.99□□□□□ -2.25
YPR003CP53394 HUG1YML058W-A 207 nt0.99□□□□□ -2.25
YPR003CP53394 SCC2YDR180W 4482 nt0.96□□□□□ -2.26
YPR003CP53394 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt0.96□□□□□ -2.26
YPR003CP53394 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt0.96□□□□□ -2.26
YPR003CP53394 YSP1YHR155W 3687 nt0.96□□□□□ -2.26
YPR003CP53394 YDL073WYDL073W 2955 nt0.95□□□□□ -2.26
YPR003CP53394 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.95□□□□□ -2.26
YPR003CP53394 UTP20YBL004W 7482 nt0.94□□□□□ -2.26
YPR003CP53394 YDR544CYDR544C 429 nt0.94□□□□□ -2.26
YPR003CP53394 QCR9YGR183C 201 nt0.92□□□□□ -2.26
YPR003CP53394 PAU24YBR301W 363 nt0.92□□□□□ -2.26
YPR003CP53394 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt0.9□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 OST4YDL232W 111 nt0.89□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 RPM2YML091C 3609 nt0.89□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 COG6YNL041C 2520 nt0.89□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.88□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.88□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 snR39BsnR39B 96 nt0.88□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt0.86□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.85□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 YDR210WYDR210W 228 nt0.84□□□□□ -2.27
YPR003CP53394 GLG1YKR058W 1851 nt0.84□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 RKR1YMR247C 4689 nt0.83□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.83□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.83□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 ULP2YIL031W 3105 nt0.82□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.82□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 SOM1YEL059C-A 225 nt0.82□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 LTE1YAL024C 4308 nt0.8□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 NNF2YGR089W 2811 nt0.79□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 SEC1YDR164C 2175 nt0.79□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.79□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.79□□□□□ -2.28
YPR003CP53394 MYO1YHR023W 5787 nt0.75□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 YBR099CYBR099C 384 nt0.75□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 BIR1YJR089W 2865 nt0.75□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.74□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 YNL205CYNL205C 423 nt0.73□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 CSE1YGL238W 2883 nt0.73□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 PET111YMR257C 2403 nt0.72□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 YMR160WYMR160W 2451 nt0.72□□□□□ -2.29
YPR003CP53394 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.71□□□□□ -2.3
YPR003CP53394 NIP1YMR309C 2439 nt0.68□□□□□ -2.3
YPR003CP53394 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms