Protein–RNA interactions for Protein: P53009

SCY1, Protein kinase-like protein SCY1, yeastyeast

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCY1P53009 GIP3YPL137C 3831 nt2.75□□□□□ -1.97
SCY1P53009 SPO14YKR031C 5052 nt2.75□□□□□ -1.97
SCY1P53009 UTP22YGR090W 3714 nt2.74□□□□□ -1.97
SCY1P53009 GEA2YEL022W 4380 nt2.73□□□□□ -1.97
SCY1P53009 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.72□□□□□ -1.97
SCY1P53009 CHC1YGL206C 4962 nt2.71□□□□□ -1.98
SCY1P53009 DYN1YKR054C 12279 nt2.7□□□□□ -1.98
SCY1P53009 ECM29YHL030W 5607 nt2.69□□□□□ -1.98
SCY1P53009 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2.69□□□□□ -1.98
SCY1P53009 MLP2YIL149C 5040 nt2.69□□□□□ -1.98
SCY1P53009 SPF1YEL031W 3648 nt2.68□□□□□ -1.98
SCY1P53009 FAR11YNL127W 2862 nt2.68□□□□□ -1.98
SCY1P53009 RGC1YPR115W 3252 nt2.68□□□□□ -1.98
SCY1P53009 KAP122YGL016W 3246 nt2.68□□□□□ -1.98
SCY1P53009 SAP1YER047C 2694 nt2.67□□□□□ -1.98
SCY1P53009 SEC7YDR170C 6030 nt2.67□□□□□ -1.98
SCY1P53009 MSB2YGR014W 3921 nt2.67□□□□□ -1.98
SCY1P53009 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.66□□□□□ -1.98
SCY1P53009 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.66□□□□□ -1.98
SCY1P53009 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.66□□□□□ -1.98
SCY1P53009 YPL216WYPL216W 3309 nt2.66□□□□□ -1.98
SCY1P53009 GEA1YJR031C 4227 nt2.65□□□□□ -1.98
SCY1P53009 FYV8YGR196C 2454 nt2.63□□□□□ -1.99
SCY1P53009 CYR1YJL005W 6081 nt2.63□□□□□ -1.99
SCY1P53009 UBP2YOR124C 3819 nt2.61□□□□□ -1.99
SCY1P53009 HER1YOR227W 3741 nt2.61□□□□□ -1.99
SCY1P53009 YER090C-AYER090C-A 90 nt2.61□□□□□ -1.99
SCY1P53009 BNR1YIL159W 4128 nt2.61□□□□□ -1.99
SCY1P53009 ESL2YKR096W 3588 nt2.6□□□□□ -1.99
SCY1P53009 NUM1YDR150W 8247 nt2.58□□□□□ -2
SCY1P53009 AXL1YPR122W 3627 nt2.57□□□□□ -2
SCY1P53009 FLO11YIR019C 4104 nt2.57□□□□□ -2
SCY1P53009 ESC1YMR219W 4977 nt2.55□□□□□ -2
SCY1P53009 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt2.55□□□□□ -2
SCY1P53009 APL3YBL037W 3078 nt2.55□□□□□ -2
SCY1P53009 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
SCY1P53009 INO80YGL150C 4470 nt2.54□□□□□ -2
SCY1P53009 YMR160WYMR160W 2451 nt2.53□□□□□ -2
SCY1P53009 SMC4YLR086W 4257 nt2.52□□□□□ -2.01
SCY1P53009 TOP2YNL088W 4287 nt2.52□□□□□ -2.01
SCY1P53009 ATG9YDL149W 2994 nt2.52□□□□□ -2.01
SCY1P53009 RAV1YJR033C 4074 nt2.5□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YER138CYER138C 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YER160CYER160C 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YJR027WYJR027W 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YML039WYML039W 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YML045WYML045W 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YMR050CYMR050C 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 KRE33YNL132W 3171 nt2.49□□□□□ -2.01
SCY1P53009 TRA1YHR099W 11235 nt2.48□□□□□ -2.01
SCY1P53009 PSD2YGR170W 3417 nt2.47□□□□□ -2.01
SCY1P53009 CSF1YLR087C 8877 nt2.46□□□□□ -2.02
SCY1P53009 snR67snR67 82 nt2.46□□□□□ -2.02
SCY1P53009 TOR1YJR066W 7413 nt2.46□□□□□ -2.02
SCY1P53009 YOL098CYOL098C 3114 nt2.45□□□□□ -2.02
SCY1P53009 SKI3YPR189W 4299 nt2.44□□□□□ -2.02
SCY1P53009 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.43□□□□□ -2.02
SCY1P53009 PDR11YIL013C 4236 nt2.42□□□□□ -2.02
SCY1P53009 BCK1YJL095W 4437 nt2.41□□□□□ -2.02
SCY1P53009 YLR419WYLR419W 4308 nt2.41□□□□□ -2.02
SCY1P53009 SEC31YDL195W 3822 nt2.39□□□□□ -2.03
SCY1P53009 NUP145YGL092W 3954 nt2.39□□□□□ -2.03
SCY1P53009 SWI4YER111C 3282 nt2.38□□□□□ -2.03
SCY1P53009 NUP192YJL039C 5052 nt2.38□□□□□ -2.03
SCY1P53009 UBR2YLR024C 5619 nt2.36□□□□□ -2.03
SCY1P53009 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
SCY1P53009 MYO4YAL029C 4416 nt2.34□□□□□ -2.04
SCY1P53009 NEO1YIL048W 3456 nt2.32□□□□□ -2.04
SCY1P53009 FKS3YMR306W 5358 nt2.32□□□□□ -2.04
SCY1P53009 SGS1YMR190C 4344 nt2.31□□□□□ -2.04
SCY1P53009 snR70snR70 164 nt2.3□□□□□ -2.04
SCY1P53009 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.3□□□□□ -2.04
SCY1P53009 VPS13YLL040C 9435 nt2.3□□□□□ -2.04
SCY1P53009 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt2.3□□□□□ -2.04
SCY1P53009 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SCY1P53009 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SCY1P53009 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SCY1P53009 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SCY1P53009 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SCY1P53009 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SCY1P53009 REV3YPL167C 4515 nt2.25□□□□□ -2.05
SCY1P53009 CLU1YMR012W 3834 nt2.24□□□□□ -2.05
SCY1P53009 DNF1YER166W 4716 nt2.23□□□□□ -2.05
SCY1P53009 NUP188YML103C 4968 nt2.23□□□□□ -2.05
SCY1P53009 SPT7YBR081C 3999 nt2.21□□□□□ -2.06
SCY1P53009 BPH1YCR032W 6504 nt2.2□□□□□ -2.06
SCY1P53009 IRA2YOL081W 9240 nt2.18□□□□□ -2.06
SCY1P53009 NUP170YBL079W 4509 nt2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms