Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHKA1P46020 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHKA1P46020 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.5 ms