Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms