Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC62Q6P9F0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC62Q6P9F0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms