Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 IRA1YBR140C 9279 nt1.84□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.84□□□□□ -2.11
CLF1Q12309 YEL073CYEL073C 324 nt1.83□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 NUP157YER105C 4176 nt1.83□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 NCA2YPR155C 1851 nt1.83□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 SKI3YPR189W 4299 nt1.83□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 SLD3YGL113W 2007 nt1.82□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 PTP2YOR208W 2253 nt1.82□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 PRP42YDR235W 1635 nt1.81□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 PKH2YOL100W 3246 nt1.81□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 CTF4YPR135W 2784 nt1.81□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.81□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.8□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 RPS30BYOR182C 192 nt1.8□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 YPL044CYPL044C 549 nt1.79□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 SPO24YPR036W-A 204 nt1.79□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 SLI15YBR156C 2097 nt1.79□□□□□ -2.12
CLF1Q12309 PBY1YBR094W 2262 nt1.78□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.77□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 COX12YLR038C 252 nt1.77□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 LAA1YJL207C 6045 nt1.76□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 PAA1YDR071C 576 nt1.76□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 CDC31YOR257W 486 nt1.76□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 snR48snR48 113 nt1.76□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 TRM732YMR259C 4263 nt1.76□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 PMD1YER132C 5262 nt1.76□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 SPC110YDR356W 2835 nt1.75□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 EMC5YIL027C 426 nt1.75□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 snR14snR14 160 nt1.75□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 NUT1YGL151W 3399 nt1.75□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 KCS1YDR017C 3153 nt1.74□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 YNL205CYNL205C 423 nt1.73□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 RAD50YNL250W 3939 nt1.72□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 POL5YEL055C 3069 nt1.72□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 SXM1YDR395W 2835 nt1.72□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 SSK2YNR031C 4740 nt1.72□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 BST1YFL025C 3090 nt1.72□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 SMC4YLR086W 4257 nt1.71□□□□□ -2.13
CLF1Q12309 YDL206WYDL206W 2289 nt1.7□□□□□ -2.14
CLF1Q12309 YJL022WYJL022W 309 nt1.7□□□□□ -2.14
CLF1Q12309 UFD2YDL190C 2886 nt1.69□□□□□ -2.14
CLF1Q12309 SLX4YLR135W 2247 nt1.68□□□□□ -2.14
CLF1Q12309 TTI1YKL033W 3117 nt1.67□□□□□ -2.14
CLF1Q12309 PIK1YNL267W 3201 nt1.67□□□□□ -2.14
CLF1Q12309 snR85snR85 171 nt1.66□□□□□ -2.14
CLF1Q12309 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.66□□□□□ -2.14
CLF1Q12309 ALY2YJL084C 3141 nt1.65□□□□□ -2.14
CLF1Q12309 YNL211CYNL211C 261 nt1.65□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 KAP122YGL016W 3246 nt1.64□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.64□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.64□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YOR102WYOR102W 351 nt1.64□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YLR422WYLR422W 5799 nt1.64□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 APL1YJR005W 2103 nt1.64□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YLL054CYLL054C 2532 nt1.64□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 HKR1YDR420W 5409 nt1.63□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.63□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 FYV8YGR196C 2454 nt1.63□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.62□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.62□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 SEC21YNL287W 2808 nt1.62□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YAR009CYAR009C 3591 nt1.62□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 SNU13YEL026W 381 nt1.61□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.61□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.61□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 CCH1YGR217W 6120 nt1.6□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 PET127YOR017W 2403 nt1.6□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 IML1YJR138W 4755 nt1.6□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 EST2YLR318W 2655 nt1.59□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YGR130CYGR130C 2451 nt1.59□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.59□□□□□ -2.15
CLF1Q12309 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.58□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 PAN2YGL094C 3348 nt1.57□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.57□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 YCS4YLR272C 3531 nt1.57□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 SET3YKR029C 2256 nt1.57□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 MMS4YBR098W 2076 nt1.57□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 EAF1YDR359C 2949 nt1.56□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 PRP5YBR237W 2550 nt1.56□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 AZF1YOR113W 2745 nt1.56□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.56□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 STO1YMR125W 2586 nt1.56□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 NUP188YML103C 4968 nt1.55□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.55□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 STB6YKL072W 2301 nt1.54□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 ASE1YOR058C 2658 nt1.54□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 BFR2YDR299W 1605 nt1.54□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 MSN5YDR335W 3675 nt1.53□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 RSM22YKL155C 1887 nt1.53□□□□□ -2.16
CLF1Q12309 CDC39YCR093W 6327 nt1.52□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 GEA2YEL022W 4380 nt1.52□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.52□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.52□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.52□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.52□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.52□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.52□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.52□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 YGL182CYGL182C 324 nt1.52□□□□□ -2.17
CLF1Q12309 CMC4YMR194C-B 222 nt1.52□□□□□ -2.17
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