Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 STF2YGR008C 255 nt2.21□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 CTR9YOL145C 3234 nt2.21□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 YDL206WYDL206W 2289 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 FRK1YPL141C 2598 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 CDC60YPL160W 3273 nt2.2□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 TOR2YKL203C 7425 nt2.19□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 UFD2YDL190C 2886 nt2.19□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 BUD2YKL092C 3315 nt2.19□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 BFR2YDR299W 1605 nt2.19□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 YJR039WYJR039W 3366 nt2.19□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 IST2YBR086C 2841 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 KOG1YHR186C 4674 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 USO1YDL058W 5373 nt2.18□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 COG6YNL041C 2520 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 QCR9YGR183C 201 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 SIR4YDR227W 4077 nt2.17□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.16□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 TFC3YAL001C 3483 nt2.16□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 ADR1YDR216W 3972 nt2.16□□□□□ -2.06
YLL054CQ12244 YMR045CYMR045C 5268 nt2.15□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 GCN2YDR283C 4980 nt2.15□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.15□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 YLL020CYLL020C 306 nt2.15□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 SPO24YPR036W-A 204 nt2.15□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 PET309YLR067C 2898 nt2.15□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 RTT101YJL047C 2529 nt2.14□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 DGR1YNL130C-A 147 nt2.14□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 UBR2YLR024C 5619 nt2.13□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 TMA7YLR262C-A 195 nt2.13□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 UFD4YKL010C 4452 nt2.13□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 NUT1YGL151W 3399 nt2.13□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 SEC63YOR254C 1992 nt2.12□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 COA6YMR244C-A 315 nt2.11□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 IRE1YHR079C 3348 nt2.11□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 UTP22YGR090W 3714 nt2.11□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 TAH1YCR060W 336 nt2.1□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.1□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.1□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 snR45snR45 172 nt2.1□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 SFB2YNL049C 2631 nt2.1□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 TRM3YDL112W 4311 nt2.09□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.09□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 SEY1YOR165W 2331 nt2.09□□□□□ -2.07
YLL054CQ12244 snR81snR81 201 nt2.08□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt2.08□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.08□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 BRE1YDL074C 2103 nt2.08□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 UTP8YGR128C 2142 nt2.08□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 COX5BYIL111W 456 nt2.07□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 ALY2YJL084C 3141 nt2.07□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 ATG9YDL149W 2994 nt2.07□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 MGA2YIR033W 3342 nt2.06□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 PDR8YLR266C 2106 nt2.06□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 INO80YGL150C 4470 nt2.06□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 FKS1YLR342W 5631 nt2.04□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 REV3YPL167C 4515 nt2.03□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 SEC31YDL195W 3822 nt2.03□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 RTP1YMR185W 2946 nt2.03□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 snR14snR14 160 nt2.03□□□□□ -2.08
YLL054CQ12244 UTP21YLR409C 2820 nt2.03□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 TDA9YML081W 3756 nt2.02□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 PAN2YGL094C 3348 nt2.01□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 TBS1YBR150C 3285 nt2.01□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 RAD50YNL250W 3939 nt2.01□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 YDR210WYDR210W 228 nt2.01□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 HER1YOR227W 3741 nt2.01□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 MSH6YDR097C 3729 nt2.01□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 YAR009CYAR009C 3591 nt2□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 RSM22YKL155C 1887 nt2□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.99□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 YLR041WYLR041W 321 nt1.99□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 MON2YNL297C 4911 nt1.98□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 EMC5YIL027C 426 nt1.98□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 KAP120YPL125W 3099 nt1.98□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 KCS1YDR017C 3153 nt1.97□□□□□ -2.09
YLL054CQ12244 TRM732YMR259C 4263 nt1.96□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 ASE1YOR058C 2658 nt1.96□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 FAB1YFR019W 6837 nt1.96□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 GYP5YPL249C 2685 nt1.95□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 MYO2YOR326W 4725 nt1.95□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.95□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 SLX4YLR135W 2247 nt1.95□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 YML002WYML002W 2214 nt1.95□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 SMC4YLR086W 4257 nt1.94□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 KAP122YGL016W 3246 nt1.94□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 SEC21YNL287W 2808 nt1.94□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 MMS4YBR098W 2076 nt1.94□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 BIR1YJR089W 2865 nt1.92□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.92□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 FYV10YIL097W 1551 nt1.92□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 MYO4YAL029C 4416 nt1.91□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.91□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 PKH3YDR466W 2697 nt1.9□□□□□ -2.1
YLL054CQ12244 NOP9YJL010C 2001 nt1.9□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 KIP1YBL063W 3336 nt1.89□□□□□ -2.11
YLL054CQ12244 YNL266WYNL266W 420 nt1.89□□□□□ -2.11
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