Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 YNL211CYNL211C 261 nt1.81□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 PAN2YGL094C 3348 nt1.81□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 UFD2YDL190C 2886 nt1.8□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 snR85snR85 171 nt1.8□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 YOR102WYOR102W 351 nt1.8□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 snR48snR48 113 nt1.8□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 CTF4YPR135W 2784 nt1.8□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 PKH3YDR466W 2697 nt1.79□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.79□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 YLL054CYLL054C 2532 nt1.79□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 SKI3YPR189W 4299 nt1.78□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.78□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.78□□□□□ -2.12
HAL9Q12180 SLX4YLR135W 2247 nt1.78□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.77□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 PRP5YBR237W 2550 nt1.76□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 RSM22YKL155C 1887 nt1.76□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.76□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 IRC20YLR247C 4671 nt1.76□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 TBS1YBR150C 3285 nt1.75□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 SMC1YFL008W 3678 nt1.75□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 MDS3YGL197W 4464 nt1.75□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 PEP1YBL017C 4740 nt1.75□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 COA6YMR244C-A 315 nt1.74□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 POL5YEL055C 3069 nt1.73□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 SMC4YLR086W 4257 nt1.73□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 FAB1YFR019W 6837 nt1.73□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 KCS1YDR017C 3153 nt1.73□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 YAR009CYAR009C 3591 nt1.73□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 YCS4YLR272C 3531 nt1.73□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.72□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 YJL022WYJL022W 309 nt1.72□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 YOR019WYOR019W 2193 nt1.72□□□□□ -2.13
HAL9Q12180 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.71□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.71□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 VPS15YBR097W 4365 nt1.71□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 RTP1YMR185W 2946 nt1.7□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 UTP8YGR128C 2142 nt1.69□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.69□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 snR14snR14 160 nt1.69□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 YLR422WYLR422W 5799 nt1.69□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 YOR093CYOR093C 4947 nt1.68□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.68□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 CLU1YMR012W 3834 nt1.67□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 FIG2YCR089W 4830 nt1.66□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 COX5BYIL111W 456 nt1.66□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 BPH1YCR032W 6504 nt1.66□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 EAF1YDR359C 2949 nt1.66□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 BFR2YDR299W 1605 nt1.66□□□□□ -2.14
HAL9Q12180 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.65□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 YLL020CYLL020C 306 nt1.65□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 KAP122YGL016W 3246 nt1.65□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 DNF3YMR162C 4971 nt1.64□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 MYO2YOR326W 4725 nt1.64□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 ANS1YHR126C 480 nt1.64□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 STO1YMR125W 2586 nt1.64□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 BST1YFL025C 3090 nt1.64□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 CDC31YOR257W 486 nt1.63□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.63□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 SET3YKR029C 2256 nt1.63□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.62□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 YGL182CYGL182C 324 nt1.62□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 CMC4YMR194C-B 222 nt1.62□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.62□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 CFT1YDR301W 4074 nt1.61□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 CHS6YJL099W 2241 nt1.61□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 YLR282CYLR282C 342 nt1.61□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 MON2YNL297C 4911 nt1.61□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 WAR1YML076C 2835 nt1.61□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 YLR419WYLR419W 4308 nt1.61□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 NOP9YJL010C 2001 nt1.6□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 YML002WYML002W 2214 nt1.6□□□□□ -2.15
HAL9Q12180 CDC25YLR310C 4770 nt1.59□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 SWI4YER111C 3282 nt1.58□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 APL3YBL037W 3078 nt1.58□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 SXM1YDR395W 2835 nt1.58□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 SPC110YDR356W 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 RPL26BYGR034W 384 nt1.56□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.56□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 NUP145YGL092W 3954 nt1.56□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 IRA1YBR140C 9279 nt1.55□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.55□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 NUP192YJL039C 5052 nt1.55□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 PIK1YNL267W 3201 nt1.55□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 TAH1YCR060W 336 nt1.54□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 ROM2YLR371W 4071 nt1.54□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 YLR041WYLR041W 321 nt1.53□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 AZF1YOR113W 2745 nt1.53□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.53□□□□□ -2.16
HAL9Q12180 MSN5YDR335W 3675 nt1.53□□□□□ -2.17
HAL9Q12180 EST2YLR318W 2655 nt1.52□□□□□ -2.17
HAL9Q12180 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.52□□□□□ -2.17
HAL9Q12180 snR190snR190 190 nt1.52□□□□□ -2.17
HAL9Q12180 BRR2YER172C 6492 nt1.52□□□□□ -2.17
HAL9Q12180 OST4YDL232W 111 nt1.51□□□□□ -2.17
HAL9Q12180 STB6YKL072W 2301 nt1.51□□□□□ -2.17
HAL9Q12180 SEC21YNL287W 2808 nt1.51□□□□□ -2.17
HAL9Q12180 CHS1YNL192W 3396 nt1.51□□□□□ -2.17
HAL9Q12180 GEA2YEL022W 4380 nt1.51□□□□□ -2.17
HAL9Q12180 FYV10YIL097W 1551 nt1.51□□□□□ -2.17
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