Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 SLX4YLR135W 2247 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 PAN2YGL094C 3348 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 SMC4YLR086W 4257 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 KIP1YBL063W 3336 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 snR14snR14 160 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 NUP170YBL079W 4509 nt1.99□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.98□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 YPP1YGR198W 2454 nt1.98□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.97□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 YJL022WYJL022W 309 nt1.97□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 MMS4YBR098W 2076 nt1.97□□□□□ -2.09
TMA46Q12000 YNL211CYNL211C 261 nt1.96□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 TMA7YLR262C-A 195 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 COA6YMR244C-A 315 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 YOR102WYOR102W 351 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 snR48snR48 113 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 YAR009CYAR009C 3591 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 YCS4YLR272C 3531 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 TOR2YKL203C 7425 nt1.95□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 YNL205CYNL205C 423 nt1.94□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 FKS1YLR342W 5631 nt1.93□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 KAP122YGL016W 3246 nt1.92□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 snR85snR85 171 nt1.91□□□□□ -2.1
TMA46Q12000 YLL054CYLL054C 2532 nt1.9□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 GYP5YPL249C 2685 nt1.9□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 PRP5YBR237W 2550 nt1.9□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 PEP1YBL017C 4740 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.89□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.88□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 CDC31YOR257W 486 nt1.88□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 TRM732YMR259C 4263 nt1.88□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.87□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 RSM22YKL155C 1887 nt1.87□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.87□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 SET3YKR029C 2256 nt1.86□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 YLR422WYLR422W 5799 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 PMD1YER132C 5262 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 STO1YMR125W 2586 nt1.85□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 PKH3YDR466W 2697 nt1.84□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.84□□□□□ -2.11
TMA46Q12000 BFR2YDR299W 1605 nt1.84□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 YOR019WYOR019W 2193 nt1.83□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 VPS15YBR097W 4365 nt1.83□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 RTP1YMR185W 2946 nt1.83□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 IRC20YLR247C 4671 nt1.82□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 SMC1YFL008W 3678 nt1.81□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 NUP157YER105C 4176 nt1.81□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 COX5BYIL111W 456 nt1.81□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 CMC4YMR194C-B 222 nt1.81□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 YGL182CYGL182C 324 nt1.8□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.8□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt1.8□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 SWI4YER111C 3282 nt1.8□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 NOP9YJL010C 2001 nt1.79□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 APL3YBL037W 3078 nt1.79□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.79□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.79□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 EAF1YDR359C 2949 nt1.79□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 YLL020CYLL020C 306 nt1.78□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 YLR282CYLR282C 342 nt1.78□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 WAR1YML076C 2835 nt1.78□□□□□ -2.12
TMA46Q12000 BST1YFL025C 3090 nt1.77□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 UTP8YGR128C 2142 nt1.77□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 CFT1YDR301W 4074 nt1.76□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.75□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 STB6YKL072W 2301 nt1.75□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 NUP188YML103C 4968 nt1.75□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 CHS6YJL099W 2241 nt1.74□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 ASE1YOR058C 2658 nt1.73□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.73□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 YML002WYML002W 2214 nt1.72□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 MYO2YOR326W 4725 nt1.72□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.72□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 GEA2YEL022W 4380 nt1.72□□□□□ -2.13
TMA46Q12000 SEC3YER008C 4011 nt1.71□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 YLR041WYLR041W 321 nt1.71□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.71□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 NUP145YGL092W 3954 nt1.7□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 TAH1YCR060W 336 nt1.7□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 EST2YLR318W 2655 nt1.69□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 RPL26BYGR034W 384 nt1.69□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt1.69□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 snR190snR190 190 nt1.69□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 AZF1YOR113W 2745 nt1.68□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 CDC39YCR093W 6327 nt1.68□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 SEC21YNL287W 2808 nt1.66□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt1.66□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 FYV10YIL097W 1551 nt1.66□□□□□ -2.14
TMA46Q12000 OST4YDL232W 111 nt1.64□□□□□ -2.15
TMA46Q12000 SXM1YDR395W 2835 nt1.63□□□□□ -2.15
TMA46Q12000 FAB1YFR019W 6837 nt1.63□□□□□ -2.15
TMA46Q12000 CDC25YLR310C 4770 nt1.61□□□□□ -2.15
TMA46Q12000 QCR9YGR183C 201 nt1.61□□□□□ -2.15
TMA46Q12000 snR39BsnR39B 96 nt1.61□□□□□ -2.15
TMA46Q12000 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.6□□□□□ -2.15
TMA46Q12000 YBR099CYBR099C 384 nt1.6□□□□□ -2.15
TMA46Q12000 ROM2YLR371W 4071 nt1.59□□□□□ -2.15
TMA46Q12000 MSN5YDR335W 3675 nt1.59□□□□□ -2.15
TMA46Q12000 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.6 ms