Protein–RNA interactions for Protein: Q08054

CSI2, Chitin synthase 3 complex protein CSI2, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2Q08054 UTP10YJL109C 5310 nt0.44□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 YLR334CYLR334C 381 nt0.44□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 YDL073WYDL073W 2955 nt0.44□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 NOP9YJL010C 2001 nt0.43□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 HMRA2YCR096C 360 nt0.43□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 RPL35AYDL191W 363 nt0.43□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.43□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 NPR2YEL062W 1848 nt0.43□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 SPO21YOL091W 1830 nt0.43□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 RPS25BYLR333C 327 nt0.42□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 YDR157WYDR157W 402 nt0.41□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.41□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 YGR035CYGR035C 351 nt0.41□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 HTB2YBL002W 396 nt0.41□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 BIL1YOR304C-A 231 nt0.41□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 CHS6YJL099W 2241 nt0.4□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 PAA1YDR071C 576 nt0.4□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 YJL120WYJL120W 324 nt0.4□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 YNL211CYNL211C 261 nt0.4□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 ULP2YIL031W 3105 nt0.39□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 YMR321CYMR321C 318 nt0.39□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 SGF11YPL047W 300 nt0.39□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 YPL225WYPL225W 441 nt0.39□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 RPL26BYGR034W 384 nt0.38□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 TAR1YLR154W-C 375 nt0.38□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 AI1Q0050 2505 nt0.37□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 YDR048CYDR048C 315 nt0.37□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 SSS1YDR086C 243 nt0.37□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.37□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.37□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 ASE1YOR058C 2658 nt0.36□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 LTE1YAL024C 4308 nt0.36□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.35□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 FMP27YLR454W 7887 nt0.34□□□□□ -2.35
CSI2Q08054 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.34□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 FYV10YIL097W 1551 nt0.34□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.34□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 PRP16YKR086W 3216 nt0.33□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.33□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.33□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.33□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.33□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 COG8YML071C 1824 nt0.33□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 SEC8YPR055W 3198 nt0.32□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.32□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.31□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YFL019CYFL019C 354 nt0.31□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.3□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 COX5BYIL111W 456 nt0.3□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.3□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 snR190snR190 190 nt0.3□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 PRP5YBR237W 2550 nt0.29□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 OST4YDL232W 111 nt0.29□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 RPS27BYHR021C 249 nt0.29□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.29□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YAF9YNL107W 681 nt0.29□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.29□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 PET111YMR257C 2403 nt0.29□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 BIR1YJR089W 2865 nt0.29□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 snR60snR60 104 nt0.28□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 SBH1YER087C-B 249 nt0.28□□□□□ -2.36
CSI2Q08054 YSP1YHR155W 3687 nt0.28□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 PRP42YDR235W 1635 nt0.27□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 VIK1YPL253C 1944 nt0.27□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.27□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.27□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 CSE2YNR010W 450 nt0.26□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YOR345CYOR345C 351 nt0.26□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YPR012WYPR012W 255 nt0.26□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YDR102CYDR102C 333 nt0.25□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.25□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YIL032CYIL032C 357 nt0.25□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.25□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YKL136WYKL136W 399 nt0.25□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.25□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 HTL1YCR020W-B 237 nt0.24□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.24□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.24□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YPR197CYPR197C 564 nt0.24□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 COY1YKL179C 2040 nt0.23□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 HAL9YOL089C 3093 nt0.23□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YLR282CYLR282C 342 nt0.23□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 YPR092WYPR092W 306 nt0.23□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 ABF2YMR072W 552 nt0.22□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 snR36snR36 182 nt0.22□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 IQG1YPL242C 4488 nt0.22□□□□□ -2.37
CSI2Q08054 ULI1YFR026C 510 nt0.21□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.21□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 BEM3YPL115C 3387 nt0.21□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 YCR022CYCR022C 345 nt0.2□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.2□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.2□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.2□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.2□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 MLP1YKR095W 5628 nt0.19□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.19□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 YGL149WYGL149W 306 nt0.19□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 NNF2YGR089W 2811 nt0.19□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 ORC3YLL004W 1851 nt0.18□□□□□ -2.38
CSI2Q08054 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.18□□□□□ -2.38
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