Protein–RNA interactions for Protein: P53317

NOP19, Nucleolar protein 19, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP19P53317 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.05□□□□□ -2.4
NOP19P53317 snR41snR41 95 nt0.05□□□□□ -2.4
NOP19P53317 snR54snR54 86 nt0.05□□□□□ -2.4
NOP19P53317 HAL9YOL089C 3093 nt0.05□□□□□ -2.4
NOP19P53317 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.04□□□□□ -2.4
NOP19P53317 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.04□□□□□ -2.4
NOP19P53317 YOR345CYOR345C 351 nt0.04□□□□□ -2.4
NOP19P53317 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt0.02□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.02□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.02□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YNL122CYNL122C 348 nt0.02□□□□□ -2.41
NOP19P53317 RCO1YMR075W 2055 nt0.01□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.01□□□□□ -2.41
NOP19P53317 ECL1YGR146C 636 nt0.01□□□□□ -2.41
NOP19P53317 TAR1YLR154W-C 375 nt0.01□□□□□ -2.41
NOP19P53317 RPS26AYGL189C 360 nt0□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YLR101CYLR101C 396 nt0□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YPL068CYPL068C 882 nt0□□□□□ -2.41
NOP19P53317 snR190snR190 190 nt0□□□□□ -2.41
NOP19P53317 THO2YNL139C 4794 nt-0□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YER006C-AYER006C-A 318 nt-0.01□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YOR053WYOR053W 342 nt-0.01□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YPL225WYPL225W 441 nt-0.01□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.02□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YLR334CYLR334C 381 nt-0.02□□□□□ -2.41
NOP19P53317 NNF2YGR089W 2811 nt-0.02□□□□□ -2.41
NOP19P53317 HMRA2YCR096C 360 nt-0.03□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YNL146WYNL146W 303 nt-0.03□□□□□ -2.41
NOP19P53317 YLR456WYLR456W 615 nt-0.04□□□□□ -2.42
NOP19P53317 MRPL50YNR022C 420 nt-0.04□□□□□ -2.42
NOP19P53317 COG8YML071C 1824 nt-0.05□□□□□ -2.42
NOP19P53317 RPS25BYLR333C 327 nt-0.05□□□□□ -2.42
NOP19P53317 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.05□□□□□ -2.42
NOP19P53317 SSS1YDR086C 243 nt-0.06□□□□□ -2.42
NOP19P53317 PCC1YKR095W-A 267 nt-0.07□□□□□ -2.42
NOP19P53317 YPR092WYPR092W 306 nt-0.07□□□□□ -2.42
NOP19P53317 COY1YKL179C 2040 nt-0.09□□□□□ -2.42
NOP19P53317 YJL120WYJL120W 324 nt-0.09□□□□□ -2.42
NOP19P53317 NIP1YMR309C 2439 nt-0.09□□□□□ -2.42
NOP19P53317 YHR138CYHR138C 345 nt-0.1□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.1□□□□□ -2.43
NOP19P53317 RPL35AYDL191W 363 nt-0.11□□□□□ -2.43
NOP19P53317 CSN9YDR179C 489 nt-0.11□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-0.11□□□□□ -2.43
NOP19P53317 ULI1YFR026C 510 nt-0.12□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YAR029WYAR029W 225 nt-0.12□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YLR232WYLR232W 348 nt-0.12□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YNL303WYNL303W 348 nt-0.12□□□□□ -2.43
NOP19P53317 snR45snR45 172 nt-0.12□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-0.13□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.13□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.15□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YKL136WYKL136W 399 nt-0.15□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YLR282CYLR282C 342 nt-0.15□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YLR434CYLR434C 384 nt-0.15□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-0.15□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YKU70YMR284W 1809 nt-0.15□□□□□ -2.43
NOP19P53317 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-0.17□□□□□ -2.44
NOP19P53317 VPS20YMR077C 666 nt-0.17□□□□□ -2.44
NOP19P53317 YEL073CYEL073C 324 nt-0.18□□□□□ -2.44
NOP19P53317 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-0.18□□□□□ -2.44
NOP19P53317 YCR022CYCR022C 345 nt-0.19□□□□□ -2.44
NOP19P53317 SOV1YMR066W 2697 nt-0.19□□□□□ -2.44
NOP19P53317 YDL158CYDL158C 309 nt-0.2□□□□□ -2.44
NOP19P53317 ATP19YOL077W-A 207 nt-0.2□□□□□ -2.44
NOP19P53317 PRM3YPL192C 402 nt-0.2□□□□□ -2.44
NOP19P53317 BUL2YML111W 2763 nt-0.21□□□□□ -2.44
NOP19P53317 snR128snR128 126 nt-0.23□□□□□ -2.45
NOP19P53317 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.25□□□□□ -2.45
NOP19P53317 YPL205CYPL205C 345 nt-0.25□□□□□ -2.45
NOP19P53317 snR8snR8 190 nt-0.26□□□□□ -2.45
NOP19P53317 SNU13YEL026W 381 nt-0.27□□□□□ -2.45
NOP19P53317 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-0.27□□□□□ -2.45
NOP19P53317 YAR053WYAR053W 297 nt-0.27□□□□□ -2.45
NOP19P53317 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt-0.27□□□□□ -2.45
NOP19P53317 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-0.28□□□□□ -2.45
NOP19P53317 YDR210WYDR210W 228 nt-0.29□□□□□ -2.46
NOP19P53317 YER137W-AYER137W-A 306 nt-0.29□□□□□ -2.46
NOP19P53317 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt-0.29□□□□□ -2.46
NOP19P53317 HTB2YBL002W 396 nt-0.29□□□□□ -2.46
NOP19P53317 RPS27BYHR021C 249 nt-0.3□□□□□ -2.46
NOP19P53317 PRP39YML046W 1890 nt-0.31□□□□□ -2.46
NOP19P53317 BLI1YKL061W 342 nt-0.31□□□□□ -2.46
NOP19P53317 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-0.31□□□□□ -2.46
NOP19P53317 YDR048CYDR048C 315 nt-0.32□□□□□ -2.46
NOP19P53317 YDR366CYDR366C 399 nt-0.32□□□□□ -2.46
NOP19P53317 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-0.33□□□□□ -2.46
NOP19P53317 CSE1YGL238W 2883 nt-0.34□□□□□ -2.46
NOP19P53317 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-0.34□□□□□ -2.46
NOP19P53317 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.35□□□□□ -2.47
NOP19P53317 YLR041WYLR041W 321 nt-0.35□□□□□ -2.47
NOP19P53317 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-0.35□□□□□ -2.47
NOP19P53317 CSE2YNR010W 450 nt-0.35□□□□□ -2.47
NOP19P53317 YBR285WYBR285W 435 nt-0.35□□□□□ -2.47
NOP19P53317 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-0.36□□□□□ -2.47
NOP19P53317 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt-0.36□□□□□ -2.47
NOP19P53317 snR189snR189 189 nt-0.36□□□□□ -2.47
NOP19P53317 SBH2YER019C-A 267 nt-0.37□□□□□ -2.47
NOP19P53317 YJL007CYJL007C 315 nt-0.37□□□□□ -2.47
NOP19P53317 YLR202CYLR202C 327 nt-0.37□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.3 ms