Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 NUP157YER105C 4176 nt1.9□□□□□ -2.11
CUE2P36075 MET18YIL128W 3099 nt1.9□□□□□ -2.11
CUE2P36075 SAS3YBL052C 2496 nt1.9□□□□□ -2.11
CUE2P36075 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.89□□□□□ -2.11
CUE2P36075 APL2YKL135C 2181 nt1.89□□□□□ -2.11
CUE2P36075 MMS22YLR320W 4365 nt1.88□□□□□ -2.11
CUE2P36075 YGL182CYGL182C 324 nt1.88□□□□□ -2.11
CUE2P36075 QCR9YGR183C 201 nt1.88□□□□□ -2.11
CUE2P36075 ALK1YGL021W 2283 nt1.88□□□□□ -2.11
CUE2P36075 PTP2YOR208W 2253 nt1.87□□□□□ -2.11
CUE2P36075 CHC1YGL206C 4962 nt1.87□□□□□ -2.11
CUE2P36075 HER1YOR227W 3741 nt1.87□□□□□ -2.11
CUE2P36075 TTI1YKL033W 3117 nt1.86□□□□□ -2.11
CUE2P36075 RTP1YMR185W 2946 nt1.86□□□□□ -2.11
CUE2P36075 LHS1YKL073W 2646 nt1.86□□□□□ -2.11
CUE2P36075 snR62snR62 100 nt1.86□□□□□ -2.11
CUE2P36075 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.86□□□□□ -2.11
CUE2P36075 BPH1YCR032W 6504 nt1.85□□□□□ -2.11
CUE2P36075 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.85□□□□□ -2.11
CUE2P36075 TRL1YJL087C 2484 nt1.85□□□□□ -2.11
CUE2P36075 GYP5YPL249C 2685 nt1.84□□□□□ -2.11
CUE2P36075 YMR045CYMR045C 5268 nt1.84□□□□□ -2.11
CUE2P36075 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.84□□□□□ -2.11
CUE2P36075 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.83□□□□□ -2.12
CUE2P36075 SLX4YLR135W 2247 nt1.83□□□□□ -2.12
CUE2P36075 ADR1YDR216W 3972 nt1.83□□□□□ -2.12
CUE2P36075 FAB1YFR019W 6837 nt1.82□□□□□ -2.12
CUE2P36075 CDC60YPL160W 3273 nt1.81□□□□□ -2.12
CUE2P36075 DCP2YNL118C 2913 nt1.81□□□□□ -2.12
CUE2P36075 PKH3YDR466W 2697 nt1.81□□□□□ -2.12
CUE2P36075 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.81□□□□□ -2.12
CUE2P36075 YLR419WYLR419W 4308 nt1.8□□□□□ -2.12
CUE2P36075 COG6YNL041C 2520 nt1.8□□□□□ -2.12
CUE2P36075 HMI1YOL095C 2121 nt1.79□□□□□ -2.12
CUE2P36075 APL1YJR005W 2103 nt1.79□□□□□ -2.12
CUE2P36075 MLH3YPL164C 2148 nt1.79□□□□□ -2.12
CUE2P36075 MSH5YDL154W 2706 nt1.79□□□□□ -2.12
CUE2P36075 PKH2YOL100W 3246 nt1.78□□□□□ -2.12
CUE2P36075 MYO2YOR326W 4725 nt1.78□□□□□ -2.12
CUE2P36075 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.78□□□□□ -2.13
CUE2P36075 MAK10YEL053C 2202 nt1.77□□□□□ -2.13
CUE2P36075 BFR2YDR299W 1605 nt1.77□□□□□ -2.13
CUE2P36075 COG4YPR105C 2586 nt1.76□□□□□ -2.13
CUE2P36075 EAF1YDR359C 2949 nt1.76□□□□□ -2.13
CUE2P36075 DNF3YMR162C 4971 nt1.76□□□□□ -2.13
CUE2P36075 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.76□□□□□ -2.13
CUE2P36075 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.76□□□□□ -2.13
CUE2P36075 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.76□□□□□ -2.13
CUE2P36075 YOR093CYOR093C 4947 nt1.76□□□□□ -2.13
CUE2P36075 UBR2YLR024C 5619 nt1.76□□□□□ -2.13
CUE2P36075 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.75□□□□□ -2.13
CUE2P36075 YLL020CYLL020C 306 nt1.75□□□□□ -2.13
CUE2P36075 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.75□□□□□ -2.13
CUE2P36075 IRC20YLR247C 4671 nt1.75□□□□□ -2.13
CUE2P36075 UTP21YLR409C 2820 nt1.74□□□□□ -2.13
CUE2P36075 UTP8YGR128C 2142 nt1.74□□□□□ -2.13
CUE2P36075 YLR422WYLR422W 5799 nt1.74□□□□□ -2.13
CUE2P36075 TAH1YCR060W 336 nt1.73□□□□□ -2.13
CUE2P36075 TDA9YML081W 3756 nt1.72□□□□□ -2.13
CUE2P36075 UFD2YDL190C 2886 nt1.72□□□□□ -2.13
CUE2P36075 RPL37BYDR500C 267 nt1.71□□□□□ -2.14
CUE2P36075 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.71□□□□□ -2.14
CUE2P36075 YDL206WYDL206W 2289 nt1.71□□□□□ -2.14
CUE2P36075 SLI15YBR156C 2097 nt1.7□□□□□ -2.14
CUE2P36075 YDR210WYDR210W 228 nt1.7□□□□□ -2.14
CUE2P36075 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.7□□□□□ -2.14
CUE2P36075 HIR3YJR140C 4947 nt1.7□□□□□ -2.14
CUE2P36075 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt1.69□□□□□ -2.14
CUE2P36075 YJR039WYJR039W 3366 nt1.68□□□□□ -2.14
CUE2P36075 KAP120YPL125W 3099 nt1.68□□□□□ -2.14
CUE2P36075 POL5YEL055C 3069 nt1.68□□□□□ -2.14
CUE2P36075 SYH1YPL105C 2550 nt1.67□□□□□ -2.14
CUE2P36075 BIR1YJR089W 2865 nt1.67□□□□□ -2.14
CUE2P36075 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt1.67□□□□□ -2.14
CUE2P36075 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.67□□□□□ -2.14
CUE2P36075 COA6YMR244C-A 315 nt1.67□□□□□ -2.14
CUE2P36075 YNL266WYNL266W 420 nt1.67□□□□□ -2.14
CUE2P36075 MYO4YAL029C 4416 nt1.67□□□□□ -2.14
CUE2P36075 SET3YKR029C 2256 nt1.66□□□□□ -2.14
CUE2P36075 FRK1YPL141C 2598 nt1.66□□□□□ -2.14
CUE2P36075 CFT1YDR301W 4074 nt1.66□□□□□ -2.14
CUE2P36075 PEP1YBL017C 4740 nt1.64□□□□□ -2.15
CUE2P36075 TBS1YBR150C 3285 nt1.64□□□□□ -2.15
CUE2P36075 COX5BYIL111W 456 nt1.63□□□□□ -2.15
CUE2P36075 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.63□□□□□ -2.15
CUE2P36075 YLR232WYLR232W 348 nt1.63□□□□□ -2.15
CUE2P36075 SPO24YPR036W-A 204 nt1.63□□□□□ -2.15
CUE2P36075 VPS15YBR097W 4365 nt1.63□□□□□ -2.15
CUE2P36075 CTR9YOL145C 3234 nt1.62□□□□□ -2.15
CUE2P36075 SEC1YDR164C 2175 nt1.62□□□□□ -2.15
CUE2P36075 PET309YLR067C 2898 nt1.62□□□□□ -2.15
CUE2P36075 SEY1YOR165W 2331 nt1.61□□□□□ -2.15
CUE2P36075 SPC110YDR356W 2835 nt1.6□□□□□ -2.15
CUE2P36075 SEC21YNL287W 2808 nt1.6□□□□□ -2.15
CUE2P36075 PMD1YER132C 5262 nt1.6□□□□□ -2.15
CUE2P36075 CHS1YNL192W 3396 nt1.59□□□□□ -2.15
CUE2P36075 RSM22YKL155C 1887 nt1.59□□□□□ -2.15
CUE2P36075 RPS26AYGL189C 360 nt1.59□□□□□ -2.15
CUE2P36075 IRE1YHR079C 3348 nt1.59□□□□□ -2.16
CUE2P36075 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 84 ms