Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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