Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
INPP4AQ96PE3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INPP4AQ96PE3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms