Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIRT1Q96EB6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIRT1Q96EB6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms