Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR88Q6ZMY6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR88Q6ZMY6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms