Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 KAP123YER110C 3342 nt3.5□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 PDR3YBL005W 2931 nt3.5□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt3.5□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 COG4YPR105C 2586 nt3.48□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 PNC1YGL037C 651 nt3.48□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 PRP6YBR055C 2700 nt3.48□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 SLN1YIL147C 3663 nt3.48□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 RPS22AYJL190C 393 nt3.47□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 YLR041WYLR041W 321 nt3.47□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 ROM1YGR070W 3468 nt3.47□□□□□ -1.85
MSB4Q12317 ZRG8YER033C 3231 nt3.46□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt3.46□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 MET5YJR137C 4329 nt3.46□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 YDR186CYDR186C 2634 nt3.45□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 DRS2YAL026C 4068 nt3.45□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 AFI1YOR129C 2682 nt3.45□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 SWR1YDR334W 4545 nt3.45□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 RAX2YLR084C 3663 nt3.45□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 PSY2YNL201C 2577 nt3.45□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 NUP157YER105C 4176 nt3.44□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 PSK1YAL017W 4071 nt3.44□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt3.44□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 NOP14YDL148C 2433 nt3.43□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 MDS3YGL197W 4464 nt3.43□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt3.42□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 SGS1YMR190C 4344 nt3.41□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 YSP2YDR326C 4317 nt3.41□□□□□ -1.86
MSB4Q12317 IST2YBR086C 2841 nt3.39□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 UFD2YDL190C 2886 nt3.38□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 MET6YER091C 2304 nt3.38□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 MGM1YOR211C 2646 nt3.38□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 FKS3YMR306W 5358 nt3.37□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 RTP1YMR185W 2946 nt3.36□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 TIM9YEL020W-A 264 nt3.35□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 GCV2YMR189W 3105 nt3.35□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 PMR1YGL167C 2853 nt3.35□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 YJR039WYJR039W 3366 nt3.34□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt3.34□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 REV3YPL167C 4515 nt3.34□□□□□ -1.87
MSB4Q12317 PKH2YOL100W 3246 nt3.34□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 DCP2YNL118C 2913 nt3.32□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 TFC4YGR047C 3078 nt3.32□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 TSC11YER093C 4293 nt3.32□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 SAP185YJL098W 3177 nt3.31□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 VTC3YPL019C 2508 nt3.31□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 DYN1YKR054C 12279 nt3.31□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 UBP3YER151C 2739 nt3.3□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 SPO71YDR104C 3738 nt3.3□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 DSE4YNR067C 3354 nt3.3□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 NFT1YKR103W 3657 nt3.3□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 TBS1YBR150C 3285 nt3.29□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 ESL1YIL151C 3357 nt3.29□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 VPS16YPL045W 2397 nt3.29□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 RPS29AYLR388W 171 nt3.28□□□□□ -1.88
MSB4Q12317 BUD4YJR092W 4344 nt3.27□□□□□ -1.89
MSB4Q12317 SEC10YLR166C 2616 nt3.27□□□□□ -1.89
MSB4Q12317 IKI3YLR384C 4050 nt3.25□□□□□ -1.89
MSB4Q12317 MMS22YLR320W 4365 nt3.25□□□□□ -1.89
MSB4Q12317 NET1YJL076W 3570 nt3.25□□□□□ -1.89
MSB4Q12317 SKI7YOR076C 2244 nt3.24□□□□□ -1.89
MSB4Q12317 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt3.24□□□□□ -1.89
MSB4Q12317 SDC25YLL016W 3147 nt3.23□□□□□ -1.89
MSB4Q12317 SEC21YNL287W 2808 nt3.22□□□□□ -1.89
MSB4Q12317 CDC53YDL132W 2448 nt3.22□□□□□ -1.89
MSB4Q12317 YGR067CYGR067C 2415 nt3.21□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 POL5YEL055C 3069 nt3.21□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 TAO3YIL129C 7131 nt3.2□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 RGR1YLR071C 3249 nt3.19□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 MGA2YIR033W 3342 nt3.19□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt3.19□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 YLR278CYLR278C 4026 nt3.19□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 RPM2YML091C 3609 nt3.19□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 CDC60YPL160W 3273 nt3.18□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 AZF1YOR113W 2745 nt3.18□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 ISW1YBR245C 3390 nt3.18□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 RSM22YKL155C 1887 nt3.18□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 SEC7YDR170C 6030 nt3.17□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 BCK1YJL095W 4437 nt3.17□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 BPT1YLL015W 4680 nt3.17□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 PIK1YNL267W 3201 nt3.17□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 MMS1YPR164W 4224 nt3.17□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt3.16□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 CAF120YNL278W 3183 nt3.16□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt3.15□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 SCP160YJL080C 3669 nt3.15□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 SLI15YBR156C 2097 nt3.15□□□□□ -1.9
MSB4Q12317 AI1Q0050 2505 nt3.15□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 RPO41YFL036W 4056 nt3.15□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 FRK1YPL141C 2598 nt3.15□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 MOT1YPL082C 5604 nt3.15□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.14□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.14□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3.14□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3.14□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 YER138CYER138C 5268 nt3.14□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 YER160CYER160C 5268 nt3.14□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt3.14□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3.14□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 YJR027WYJR027W 5268 nt3.14□□□□□ -1.91
MSB4Q12317 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt3.14□□□□□ -1.91
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