Protein–RNA interactions for Protein: Q12192

RFM1, Repression factor of MSEs protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RFM1Q12192 ZRG17YNR039C 1818 nt1.19□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YGL052WYGL052W 306 nt1.19□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.19□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.19□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YNL337WYNL337W 255 nt1.19□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 MAK10YEL053C 2202 nt1.19□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 MSH5YDL154W 2706 nt1.18□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 SEC21YNL287W 2808 nt1.18□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 PAU2YEL049W 363 nt1.18□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 GPG1YGL121C 381 nt1.18□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.18□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 IES4YOR189W 351 nt1.18□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 FYV8YGR196C 2454 nt1.18□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 SMC4YLR086W 4257 nt1.18□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 IRR1YIL026C 3453 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 EST2YLR318W 2655 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 BUD3YCL014W 4911 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 VPS55YJR044C 423 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YMR321CYMR321C 318 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YNL198CYNL198C 303 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YOR015WYOR015W 360 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 DGR2YKL121W 2559 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 CDC25YLR310C 4770 nt1.17□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 SAS3YBL052C 2496 nt1.16□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.16□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.16□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YOL160WYOL160W 342 nt1.16□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 NPR2YEL062W 1848 nt1.16□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 MSN5YDR335W 3675 nt1.16□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 MLH3YPL164C 2148 nt1.16□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 YCK3YER123W 1575 nt1.16□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 PDE2YOR360C 1581 nt1.16□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 MPT5YGL178W 2580 nt1.15□□□□□ -2.22
RFM1Q12192 ZIP2YGL249W 2115 nt1.15□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 EMC5YIL027C 426 nt1.15□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YOR376WYOR376W 369 nt1.15□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 SEC5YDR166C 2916 nt1.15□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.14□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YOR302WYOR302W 78 nt1.14□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 VPS54YDR027C 2670 nt1.14□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.14□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 UFD2YDL190C 2886 nt1.14□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 MAD1YGL086W 2250 nt1.13□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 SPC98YNL126W 2541 nt1.13□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.13□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 PAM16YJL104W 450 nt1.13□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YPR092WYPR092W 306 nt1.13□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 AZF1YOR113W 2745 nt1.13□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 PBY1YBR094W 2262 nt1.13□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.12□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 APQ12YIL040W 417 nt1.12□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 RPL34BYIL052C 366 nt1.12□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 NIP100YPL174C 2607 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 RPS27BYHR021C 249 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YOR218CYOR218C 420 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YOR225WYOR225W 330 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YCS4YLR272C 3531 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 TRM732YMR259C 4263 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 RAD34YDR314C 2079 nt1.11□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 RAD50YNL250W 3939 nt1.1□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YLL007CYLL007C 1998 nt1.1□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 RSM22YKL155C 1887 nt1.1□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 snR74snR74 88 nt1.1□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.1□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 YGL217CYGL217C 342 nt1.1□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 NUP145YGL092W 3954 nt1.1□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 Q0032Q0032 291 nt1.09□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 RRT15YLR162W-A 189 nt1.09□□□□□ -2.23
RFM1Q12192 MCM10YIL150C 1716 nt1.09□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 APL2YKL135C 2181 nt1.08□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 ISD11YER048W-A 285 nt1.08□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 RPS25BYLR333C 327 nt1.08□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.08□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 PIG1YLR273C 1947 nt1.08□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 NUP188YML103C 4968 nt1.08□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 NOC3YLR002C 1992 nt1.08□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 SPO21YOL091W 1830 nt1.08□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 ENV11YGR071C 2583 nt1.07□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YEL014CYEL014C 306 nt1.07□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1.07□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.07□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 SLX4YLR135W 2247 nt1.07□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 RAD9YDR217C 3930 nt1.07□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 SPO75YLL005C 2607 nt1.06□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 CUL3YGR003W 2235 nt1.06□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 OLI1Q0130 231 nt1.06□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.06□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.06□□□□□ -2.24
RFM1Q12192 SGF11YPL047W 300 nt1.06□□□□□ -2.24
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