Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 SPF1YEL031W 3648 nt2.03□□□□□ -2.08
MSL5Q12186 SAP190YKR028W 3102 nt2.03□□□□□ -2.08
MSL5Q12186 SAP185YJL098W 3177 nt2.02□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 SRO77YBL106C 3033 nt2.02□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 CBF2YGR140W 2871 nt2.02□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 CHC1YGL206C 4962 nt2.02□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 DGR2YKL121W 2559 nt2.02□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 SCD5YOR329C 2619 nt2.02□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 KIP1YBL063W 3336 nt2.01□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 INO80YGL150C 4470 nt2.01□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 HAL9YOL089C 3093 nt2.01□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 SLD3YGL113W 2007 nt2.01□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 MAD1YGL086W 2250 nt2.01□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 NAM7YMR080C 2916 nt2.01□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 IST2YBR086C 2841 nt2□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 CMC4YMR194C-B 222 nt2□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 RPS30BYOR182C 192 nt2□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 UBR1YGR184C 5853 nt2□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 MMS22YLR320W 4365 nt1.99□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.99□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 CTF4YPR135W 2784 nt1.98□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 snR61snR61 90 nt1.98□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 PAA1YDR071C 576 nt1.98□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt1.98□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 CDC31YOR257W 486 nt1.98□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 HSH155YMR288W 2916 nt1.97□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 BPH1YCR032W 6504 nt1.97□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 SIR4YDR227W 4077 nt1.97□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.97□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 HSL1YKL101W 4557 nt1.96□□□□□ -2.09
MSL5Q12186 UTP22YGR090W 3714 nt1.96□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 RAV1YJR033C 4074 nt1.96□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 IRC8YJL051W 2469 nt1.95□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 PTP2YOR208W 2253 nt1.95□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.95□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt1.95□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 GIP3YPL137C 3831 nt1.95□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 YOR019WYOR019W 2193 nt1.95□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 SEC16YPL085W 6588 nt1.94□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 IRA2YOL081W 9240 nt1.94□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 MAK10YEL053C 2202 nt1.94□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 ENV11YGR071C 2583 nt1.93□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 KOG1YHR186C 4674 nt1.93□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 GYP5YPL249C 2685 nt1.93□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 APL2YKL135C 2181 nt1.93□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 CSF1YLR087C 8877 nt1.93□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 OST4YDL232W 111 nt1.92□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 TOR2YKL203C 7425 nt1.91□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 PRP5YBR237W 2550 nt1.91□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 ALK1YGL021W 2283 nt1.91□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 YLR282CYLR282C 342 nt1.91□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 MLH3YPL164C 2148 nt1.91□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 YFR016CYFR016C 3702 nt1.9□□□□□ -2.1
MSL5Q12186 SOM1YEL059C-A 225 nt1.9□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.9□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 COX12YLR038C 252 nt1.9□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YNL211CYNL211C 261 nt1.9□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 RTT101YJL047C 2529 nt1.9□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YMR045CYMR045C 5268 nt1.89□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.89□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 TMA7YLR262C-A 195 nt1.89□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 HMI1YOL095C 2121 nt1.89□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 PKH2YOL100W 3246 nt1.88□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YOL098CYOL098C 3114 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 PET309YLR067C 2898 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YDR521WYDR521W 336 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 SBH1YER087C-B 249 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YBR206WYBR206W 324 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 ATG9YDL149W 2994 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YLL054CYLL054C 2532 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 CHS6YJL099W 2241 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 TFC3YAL001C 3483 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 MGA2YIR033W 3342 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 PDR8YLR266C 2106 nt1.87□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 TRL1YJL087C 2484 nt1.86□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 SVL3YPL032C 2478 nt1.85□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 MDS3YGL197W 4464 nt1.85□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.85□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 MSH5YDL154W 2706 nt1.85□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 VPS8YAL002W 3825 nt1.85□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 CDC60YPL160W 3273 nt1.85□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 TTI1YKL033W 3117 nt1.84□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 AGC1YPR021C 2709 nt1.84□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 BUD2YKL092C 3315 nt1.84□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YDL118WYDL118W 381 nt1.84□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.84□□□□□ -2.11
MSL5Q12186 IFH1YLR223C 3258 nt1.84□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 COG4YPR105C 2586 nt1.84□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 IRE1YHR079C 3348 nt1.83□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.83□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 USO1YDL058W 5373 nt1.83□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 MET18YIL128W 3099 nt1.83□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 NEO1YIL048W 3456 nt1.83□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 YNL144CYNL144C 2223 nt1.82□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.82□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.82□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 TUS1YLR425W 3924 nt1.82□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 SLI15YBR156C 2097 nt1.81□□□□□ -2.12
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