Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 ALY2YJL084C 3141 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 YIL032CYIL032C 357 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 CDC31YOR257W 486 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 PIP2YOR363C 2991 nt1.51□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 ALG13YGL047W 609 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 FYV8YGR196C 2454 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 IFH1YLR223C 3258 nt1.5□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 snR65snR65 100 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 CAT8YMR280C 4302 nt1.49□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 SEC3YER008C 4011 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 SWI4YER111C 3282 nt1.48□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 MSN5YDR335W 3675 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 PET127YOR017W 2403 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 FIG2YCR089W 4830 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 PFD1YJL179W 330 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 YDL206WYDL206W 2289 nt1.47□□□□□ -2.17
TRM8Q12009 NUP145YGL092W 3954 nt1.46□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 FIG4YNL325C 2640 nt1.46□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 snR60snR60 104 nt1.46□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 SSS1YDR086C 243 nt1.46□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 YMR321CYMR321C 318 nt1.46□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 YLR419WYLR419W 4308 nt1.46□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 PAN2YGL094C 3348 nt1.46□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 YLR422WYLR422W 5799 nt1.45□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 snR14snR14 160 nt1.45□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 PIK1YNL267W 3201 nt1.44□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 VIK1YPL253C 1944 nt1.43□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 SSK2YNR031C 4740 nt1.43□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 YDR344CYDR344C 444 nt1.43□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 YDR521WYDR521W 336 nt1.43□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.43□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.43□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 COG8YML071C 1824 nt1.43□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 PDE2YOR360C 1581 nt1.42□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 ROM2YLR371W 4071 nt1.42□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 RPS25BYLR333C 327 nt1.42□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 SMC1YFL008W 3678 nt1.41□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 YLL020CYLL020C 306 nt1.41□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 CSE2YNR010W 450 nt1.41□□□□□ -2.18
TRM8Q12009 CDC36YDL165W 576 nt1.4□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YOR218CYOR218C 420 nt1.4□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 APL3YBL037W 3078 nt1.4□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 CCH1YGR217W 6120 nt1.39□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 SEC21YNL287W 2808 nt1.39□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 RPS27BYHR021C 249 nt1.39□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YJL120WYJL120W 324 nt1.39□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YNL028WYNL028W 318 nt1.39□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 SET3YKR029C 2256 nt1.39□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 STO1YMR125W 2586 nt1.39□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 LAA1YJL207C 6045 nt1.38□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YAR009CYAR009C 3591 nt1.38□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 MSH3YCR092C 3057 nt1.38□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.38□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.38□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.38□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 PMD1YER132C 5262 nt1.38□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 RRT15YLR162W-A 189 nt1.37□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.37□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 SPO75YLL005C 2607 nt1.37□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 CDC25YLR310C 4770 nt1.36□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YER181CYER181C 324 nt1.36□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.36□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.36□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 RAD61YDR014W 1944 nt1.36□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 NUP188YML103C 4968 nt1.36□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 RSM22YKL155C 1887 nt1.35□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YBR206WYBR206W 324 nt1.35□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 WAR1YML076C 2835 nt1.35□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 SPO21YOL091W 1830 nt1.35□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 SLD3YGL113W 2007 nt1.35□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 INA22YIR024C 651 nt1.34□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.34□□□□□ -2.19
TRM8Q12009 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 YGR069WYGR069W 336 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.33□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 IES4YOR189W 351 nt1.31□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 YGR130CYGR130C 2451 nt1.3□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 MCM10YIL150C 1716 nt1.29□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 EAF1YDR359C 2949 nt1.29□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.29□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 AHC1YOR023C 1701 nt1.28□□□□□ -2.2
TRM8Q12009 NUP157YER105C 4176 nt1.27□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 STB6YKL072W 2301 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 YBR064WYBR064W 429 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 NST1YNL091W 3723 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 RAD9YDR217C 3930 nt1.26□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 TRM732YMR259C 4263 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 OLI1Q0130 231 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 ECM12YHR021W-A 456 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.25□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 PAA1YDR071C 576 nt1.24□□□□□ -2.21
TRM8Q12009 TTI1YKL033W 3117 nt1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.3 ms