Protein–RNA interactions for Protein: Q07660

BRE4, Protein BRE4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE4Q07660 KTI11YBL071W-A 249 nt2.44□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 ARP8YOR141C 2646 nt2.44□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 SEC26YDR238C 2922 nt2.44□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 SPF1YEL031W 3648 nt2.43□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 ZRG8YER033C 3231 nt2.43□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.43□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 DGR2YKL121W 2559 nt2.42□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 PTP2YOR208W 2253 nt2.42□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.42□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.42□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.42□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.42□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 TTI1YKL033W 3117 nt2.42□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 RAV1YJR033C 4074 nt2.42□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 PDR8YLR266C 2106 nt2.42□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 SAS3YBL052C 2496 nt2.42□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 UBR1YGR184C 5853 nt2.41□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.41□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 MGM1YOR211C 2646 nt2.41□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 GIP3YPL137C 3831 nt2.4□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 ENV11YGR071C 2583 nt2.4□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 TRA1YHR099W 11235 nt2.4□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 DBP10YDL031W 2988 nt2.4□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 VPS13YLL040C 9435 nt2.39□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 SVL3YPL032C 2478 nt2.39□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 LHS1YKL073W 2646 nt2.39□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 RSE1YML049C 4086 nt2.39□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 YOL098CYOL098C 3114 nt2.38□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 NOP14YDL148C 2433 nt2.38□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 SMC6YLR383W 3345 nt2.38□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 UTP8YGR128C 2142 nt2.38□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 CSF1YLR087C 8877 nt2.37□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 YDR521WYDR521W 336 nt2.37□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 RPO41YFL036W 4056 nt2.37□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 TCB2YNL087W 3537 nt2.36□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 TOR1YJR066W 7413 nt2.36□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 NEW1YPL226W 3591 nt2.36□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.36□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 MBB1YJL199C 327 nt2.36□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 ALK1YGL021W 2283 nt2.36□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 SAP190YKR028W 3102 nt2.36□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 APL2YKL135C 2181 nt2.36□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 VTC3YPL019C 2508 nt2.35□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 HMI1YOL095C 2121 nt2.35□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt2.35□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 YOR055WYOR055W 435 nt2.35□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 TRL1YJL087C 2484 nt2.35□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 PDR1YGL013C 3207 nt2.35□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 CDC60YPL160W 3273 nt2.34□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 BUB1YGR188C 3066 nt2.34□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.34□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.34□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 YNL266WYNL266W 420 nt2.34□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 CDC53YDL132W 2448 nt2.34□□□□□ -2.03
BRE4Q07660 YPL150WYPL150W 2706 nt2.33□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt2.33□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 APL1YJR005W 2103 nt2.32□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.32□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 YLL020CYLL020C 306 nt2.32□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.32□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 RTT101YJL047C 2529 nt2.32□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 DCP2YNL118C 2913 nt2.31□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 UBP1YDL122W 2430 nt2.31□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 COG6YNL041C 2520 nt2.3□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 MET18YIL128W 3099 nt2.3□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt2.3□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 IRA2YOL081W 9240 nt2.3□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 IST2YBR086C 2841 nt2.29□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt2.29□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 PET309YLR067C 2898 nt2.29□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 YPR097WYPR097W 3222 nt2.29□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 DNF1YER166W 4716 nt2.28□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 MDS3YGL197W 4464 nt2.28□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 YPP1YGR198W 2454 nt2.28□□□□□ -2.04
BRE4Q07660 BFR2YDR299W 1605 nt2.28□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 MMS22YLR320W 4365 nt2.27□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.27□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 SAP185YJL098W 3177 nt2.27□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.26□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 HER1YOR227W 3741 nt2.26□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.25□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.25□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.25□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.25□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.25□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.25□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 snR53snR53 91 nt2.25□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 BNI1YNL271C 5862 nt2.25□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 VPS8YAL002W 3825 nt2.25□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 PKH2YOL100W 3246 nt2.25□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 BIR1YJR089W 2865 nt2.24□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 TAH1YCR060W 336 nt2.24□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.24□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 MLH3YPL164C 2148 nt2.23□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 EAF1YDR359C 2949 nt2.23□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 RPL37BYDR500C 267 nt2.23□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 KAP120YPL125W 3099 nt2.23□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 TUS1YLR425W 3924 nt2.23□□□□□ -2.05
BRE4Q07660 MAK10YEL053C 2202 nt2.22□□□□□ -2.05
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