Protein–RNA interactions for Protein: P53222

YGR035C, Uncharacterized protein YGR035C, yeastyeast

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR035CP53222 YBT1YLL048C 4986 nt2.73□□□□□ -1.97
YGR035CP53222 PDR1YGL013C 3207 nt2.73□□□□□ -1.97
YGR035CP53222 MNL2YLR057W 2550 nt2.72□□□□□ -1.97
YGR035CP53222 APL2YKL135C 2181 nt2.72□□□□□ -1.97
YGR035CP53222 DGR2YKL121W 2559 nt2.72□□□□□ -1.97
YGR035CP53222 ESL2YKR096W 3588 nt2.72□□□□□ -1.97
YGR035CP53222 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.71□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 TAH1YCR060W 336 nt2.71□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YLR232WYLR232W 348 nt2.71□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 NUP170YBL079W 4509 nt2.71□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 PRP6YBR055C 2700 nt2.7□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 SMC2YFR031C 3513 nt2.7□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 SCP160YJL080C 3669 nt2.7□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 VMR1YHL035C 4779 nt2.69□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 MLH3YPL164C 2148 nt2.69□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 PHO91YNR013C 2685 nt2.69□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 ALK1YGL021W 2283 nt2.69□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.69□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YJR039WYJR039W 3366 nt2.69□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 TAE2YPL009C 3117 nt2.68□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 MAK10YEL053C 2202 nt2.68□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 SAP190YKR028W 3102 nt2.67□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 SRO77YBL106C 3033 nt2.67□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 RTT10YPL183C 3042 nt2.67□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 RPS22AYJL190C 393 nt2.67□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 ZRG8YER033C 3231 nt2.67□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 KAP123YER110C 3342 nt2.67□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 SAS3YBL052C 2496 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 RPL37BYDR500C 267 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YER138CYER138C 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YER160CYER160C 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YJR027WYJR027W 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YML039WYML039W 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YML045WYML045W 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YMR050CYMR050C 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.66□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 NFT1YKR103W 3657 nt2.65□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 PSY2YNL201C 2577 nt2.65□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 MDS3YGL197W 4464 nt2.65□□□□□ -1.98
YGR035CP53222 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.65□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 SAP185YJL098W 3177 nt2.65□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 AXL1YPR122W 3627 nt2.64□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 AFI1YOR129C 2682 nt2.64□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.64□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 NUP157YER105C 4176 nt2.64□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 SNQ2YDR011W 4506 nt2.63□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 SWR1YDR334W 4545 nt2.63□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 JSN1YJR091C 3276 nt2.63□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 COG4YPR105C 2586 nt2.62□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 MMS4YBR098W 2076 nt2.62□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 NOP14YDL148C 2433 nt2.62□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 MGM1YOR211C 2646 nt2.62□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 YLR278CYLR278C 4026 nt2.62□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.61□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 INO80YGL150C 4470 nt2.61□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.6□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 YKL225WYKL225W 348 nt2.6□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 ARP8YOR141C 2646 nt2.59□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.59□□□□□ -1.99
YGR035CP53222 POL2YNL262W 6669 nt2.59□□□□□ -2
YGR035CP53222 UFD2YDL190C 2886 nt2.59□□□□□ -2
YGR035CP53222 RTP1YMR185W 2946 nt2.58□□□□□ -2
YGR035CP53222 FLO11YIR019C 4104 nt2.58□□□□□ -2
YGR035CP53222 IST2YBR086C 2841 nt2.58□□□□□ -2
YGR035CP53222 YGR067CYGR067C 2415 nt2.58□□□□□ -2
YGR035CP53222 ESC1YMR219W 4977 nt2.58□□□□□ -2
YGR035CP53222 PNC1YGL037C 651 nt2.58□□□□□ -2
YGR035CP53222 SLH1YGR271W 5904 nt2.57□□□□□ -2
YGR035CP53222 CYR1YJL005W 6081 nt2.57□□□□□ -2
YGR035CP53222 PDR11YIL013C 4236 nt2.56□□□□□ -2
YGR035CP53222 SRB8YCR081W 4284 nt2.56□□□□□ -2
YGR035CP53222 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
YGR035CP53222 TAF2YCR042C 4224 nt2.55□□□□□ -2
YGR035CP53222 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.55□□□□□ -2
YGR035CP53222 MSB1YOR188W 3414 nt2.54□□□□□ -2
YGR035CP53222 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.54□□□□□ -2
YGR035CP53222 MET6YER091C 2304 nt2.54□□□□□ -2
YGR035CP53222 GCV2YMR189W 3105 nt2.54□□□□□ -2
YGR035CP53222 POL5YEL055C 3069 nt2.54□□□□□ -2
YGR035CP53222 UBP3YER151C 2739 nt2.54□□□□□ -2
YGR035CP53222 VPS16YPL045W 2397 nt2.53□□□□□ -2
YGR035CP53222 YLR041WYLR041W 321 nt2.53□□□□□ -2
YGR035CP53222 PSK1YAL017W 4071 nt2.53□□□□□ -2
YGR035CP53222 NET1YJL076W 3570 nt2.53□□□□□ -2.01
YGR035CP53222 CDC53YDL132W 2448 nt2.52□□□□□ -2.01
YGR035CP53222 PKH2YOL100W 3246 nt2.51□□□□□ -2.01
YGR035CP53222 TIM9YEL020W-A 264 nt2.51□□□□□ -2.01
YGR035CP53222 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.51□□□□□ -2.01
YGR035CP53222 TBS1YBR150C 3285 nt2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.5 ms